小沙丁鱼属鱼类Cytb序列的比较分析.pdfVIP

第 28卷第 11期 水 产 科 学 VoI_28No．11 2009年 11月 FISHERIES SCIENCE NOV．2009 小沙丁鱼属鱼类 Cytb序列的比较分析 杨天燕 ，高天翔 ，郭 焱 ，孟 玮 (1．中国海洋大学 海水养殖教育部重点实验室 ，山东 青岛 266003；2．新疆水产科学 研究所 ，新疆 乌鲁木齐 830000) 摘 要：对小沙丁鱼属中的青鳞小沙丁鱼 裘氏小沙丁鱼、金色小沙丁鱼、天立体小沙丁鱼线粒体细胞 色素 b基 因部分序列 (402bp)进行测定，并 比较分析 了种间的序列差异 。lO尾样品中共检测到 9种单 倍型。同源基 因序列分析显示 T、c、A、G碱基的平均含量分别为 ：28．9 、28．2 、23．9 、19．0 ，其 中A+T含量高于G+C含量，与其他鱼类同源序列碱基特点相似。利用Kimura-2模型分析得到种间 遗传距离为0．1616~0．2653，基于 Cytb基因片段序列，构建的NJ树显示青鳞小沙丁鱼与裘 氏小沙丁 鱼亲缘关系较近 ，短体小沙丁鱼与金色小沙丁鱼亲缘关系较近 。依据分子进化速率推测 4种小沙丁鱼 发生分歧的时间约为 800万年到 1300万年前的中新世 中、晚期 ，略早于其他鱼类 。 关键词 ：青鳞小沙丁鱼；裘 氏小沙丁鱼；金色小沙丁鱼；短体小沙丁鱼；细胞色素 b基因；序列差异 中图分类号 ：Q349．2 文献标识码 ：A 文章编号 ：lO03一l1ll(2009)11-0639—05 线粒体 DNA是一种共价 闭合、环状的双链 序列 (DQ197990)，2条短体小沙丁鱼 (S．maderen— DNA分子。因其具有分子结构简单 、严格母系遗 sis)的同源序列也来 自于 GenBank，登录号分别为 传、几乎不发生重组 、进化速度快等特征 ，已经成为 DQ197991和 AF472583。样 品种类 、编号及来源 分子群体遗传学和分子系统学研究的重要标记L1]。 见表 l。 脊椎动物的线粒体基因组 中含 l3个蛋 白质编码基 表 1 样品种类、编号及来源 因、2个核糖体 RNA基因、22个转运 RNA基因以 及非编码区L2]。其中细胞色素 b基因 (Cytb)进化 速度适中，包含 的遗传进化信息量大 ，近年来 已被 广泛应用于鱼类系统发育和种类鉴别等相关领 域 ]。 小沙丁鱼属 (Sardinella)鱼类是渔业生产 中重 要的中小型经济鱼类之一，有 2O多种 。国内已报 道的小沙丁鱼属约 10余种，其 中以金色小沙丁鱼 取背部肌肉组织约0．1g于 1．5ml离心管中 (S．aurita)和裘 氏小沙 丁鱼 (S．Jussieu)产量最 并用无水乙醇固定。试验前将肌 肉从酒精中取 出， 高。小沙丁鱼属鱼类在我 国主要分布于黄海、渤 用蒸馏水洗净后充分晾干并剪碎 ，采用标准酚一氯 海，散见于东南沿海 。国外分布于 日本南部 的太平 仿法提取基因组 DNA[1引。用 l 的琼脂糖凝胶 电 洋西部海域、菲律宾、泰国、越南及马来半 岛各海 泳检测用抽提 的DNA，并稀释至适 宜浓度用于 区[7]。目前国内有关小沙丁鱼的研究甚少 ，仅在形 PCR扩增 。 态特征、分类和繁殖生物 学方面做过 一定研究工 1．2 PCR扩增 作L8 ，分子生物学方面的研究却未见报道。 用于扩增小沙丁鱼属 Cytb基 因片段 的引物分 1 材料与方法 别为 L14734一Glu5’。AACCACCGTTGT TAT T