猪IFN_基因多态及功能分析.pdfVIP

农业生物技术学报 JournalofAgriculturalBiotechnology 2008,16 (2):221~224 ·研究论文· 猪IFN-γ基因多态及功能分析* 12 12 12 3 2 2 ， ， ， ， ， ， ， ， 陈慧勇 **吴珍芳 毕英佐 赵书红 曾海玉 周 秀 （1.华南农业大学动物科技系，广州510640；2.广东温氏食品集团，新兴县527400；3.华中农业大学动物科技学院，武汉430070） 摘要：γ-干扰素（interferon-gamma，IFN-γ）在机体免疫应答调节及抵抗病毒感染方面具有重要的作用。为了探测猪IFN-γ 基因作为猪抗病育种中一种分子标记的可能性，首先对其进行了不同猪品种间的基因组测序，以揭示核苷酸水平的变化，结果 在IFN-γ基因中发现了3个单核苷酸多态（SNP）。其中2个SNP为中国地方猪种二花脸所特有。另一SNP则在杜洛克、长白、 皮特兰、圣特西及大白中具有广泛的多态分布，群体杂合度为0.4820。此多态位点经PCR-SSCP检测发现3种基因型：II基因 A碱基插入纯合型）、DD型 （A碱基缺失纯合型）和DI杂合型。该标记基因型与表型间的卡方独立性检验尚没有发现 型 （ IFN-γ基因与猪健康状况的现场记录直接相关，但多重比较分析却发现该基因与猪的繁殖性能有关。 IFN-γ；单核苷酸多态（SNP）；关联分析 关键词：猪； 中图分类号:S188 文献标识码:A 文章编号:1006-1304(2008)02-0221-04 SearchingandCharacterizingSingleNucleotide PolymorphismsinPorcineIFN-γGene 1,2 1,2 1,2 3 2 2 CHENHui-yong**,WUZhen-fang,BIYing-zuo,ZHAOShu-hong,ZENGHai-yu,ZHOUXiu (1.DepartmentofAnimalScience,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510640,China;2.GuangdongWen’sGroup, Xinxing527400,China;3.CollegeofAnimalScienceandTechnology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China) Abstract:Interferon-gamma (IFN-γ)playsanimportantroleintheinnatehostdefenseagainstviralinfection.Inordertoanalyze thevalueoftheIFN-γgenetobeageneticmarkerornotinporcinediseaseresistance,genomicsequencingwasemployedindifferent breeds.Andthreesinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)wereidentified.TwoofthemwerefoundonlyinErhualian,andtheother onewaspolymorphicwithheterozygositybeing0.4820indifferentbreeds,whichareDuroc,Landrace,PietrainandSynthethic.Three genotypesweredetectedbyPCR-SSCPfortheSNP,whichwereII(homoz