藻类植物叶绿体基因组研究进展.pdfVIP

西北植物学报 ，2010，30(1)：0208—0214 ActaBot．Borea1．-Occident．Sin． 文章编号 ：1000—4025(2010)O1—0208—07 藻类植物叶绿体基因组研究进展 吉 莉，谢树莲 ，冯 佳 (山西大学 生命科学与技术学院，太原 030006) 摘 要 ：藻类植物的cpDNA结构复杂 ，普遍缺失反向重复序列 IR，且存在 IR的藻类植物种类的cpDNA也有 IR变 短退化迹象。藻类植物 的cpDNA包含 的基 因一般 比高等植物要多，编码能力更强 。藻类植物 cpDNA全序列的测 定方法主要是 Fosmid文库构建，配合使用 Long—PCR技术 。该文对国内外有关藻类植物叶绿体基 因组结构、叶绿 体编码基因、叶绿体基因组在藻类系统发育中的应用以及藻类植物叶绿体基因组的提取和序列测定方法等进行综 述 ，为藻类植物 的系统发育和叶绿体起源以及功能基 因组学的研究提供理论依据。 关键词 ：藻类植物 ；叶绿体基 因组 ；cpDNA全序列测定 中图分类号 ：Q789 文献标识码 ：A ProgressinChloroplastGenomeofAlgae JILi，XIEShu—lian ，FENG Jia (SchoolofLifeScienceandTechnology，ShanxiUniversity，Taiyuan030006，China) Abstract：Chloroplastgenomesofalgaedisplayalargevariationinstructure，manyspeciesabsenceofIR re- gionandshow thatIR isnotanecessaryregion foralgae．Chloroplastgenomesofalgaehavemoregenes andanincreasedcodingcapacityrelativetolandhighplantchloroplastgenomes．Fosmidlibraryisahighly usefulapproach forobtainingchloroplastgenomesequences．Long—PCR can beusedtoamplifylargefrag- mentsofthegenomeusingconservedchloroplastprimers．Thepaperintroducedthestructureandgenesof chloroplastgenome，chloroplastDNA systematics，isolationofpurecpDNA andwholecpDNA sequencing methods，thatmayprovidethetheorybasisforresearchofalgalphylogeneticsandoriginofchloroplast． Keywords：algae；chloroplastgenome；wholecpDNA sequencing 近年来 ，随着分子系统学这一前沿学科研究的 计 ，目前仅报道了2O余种[4 。 不断深入 ，人们发现仅仅通过 比较个别基因的遗传 许多科学家认为，叶绿体起源于原始真核细胞 变异是不够的，基于个别序列分析的地理起源与系 内共生的蓝藻。1970年 ，Margulis提出了真核细胞 统发生关系方面仍存在许多疑问_1]。从 1986年 的内共生起源假说l2。大约在 15亿年以前，一些 Shinozaki等口]发表烟草 (Nicotianatabacum)的叶 大型的具有吞噬能力 的原始真核细胞 ，吞并 了原核 绿体基因组 (cpDNA)全序列至今，已有超过 160种 生物蓝藻，由于后者没有被分解消化 ，它们从寄生逐 植物的叶绿体基因组全序列被测定 ，另外还有很多 渐过渡到共生，成为了宿主