动物系统发育与分子系统学研究的理论基础及方法研究.pdfVIP

湖南韩业科技 2OO6年第33卷第3期 硼究报告 动物系统发育与分子系统学研究的理论基础及 方法研究进展 袁金荣，刘振湘 (湖南环境生物职业技术学院，湖南 衡阳 421005) 摘 要：介绍系统发育的概念及 目标。分子系统学是研究系统发育的重要方法，其理论基础来源于系统学、分类学、 比较生物化学、分子生物学和进化论，是基于分子水平上的比较建立分子进化树。目前构建分子系统树的方法有最 大简约法、距离矩阵法、最大似然法3种，用于系统分析的计算机软件有多序列对位排列软件和系统演化与进化分析 软件。 关键词 ：系统发育；分子系统学；系统树；动物 中图分类号：S813．24 文献标识码：A 文章编号：1003-5710(2006)03-0001-03 Thetheoreticalbasisand thedevelopmentofresearchmethods ofanimalphylogenyandmolecularsystematics YUANJin—rong，LIUZhen—xiang (nun~ PolytecnicofBiology＆Environment，Hengyang421005，China) Abstract：Theconceptandobjectiveofphylogenywasintroducedinthisessay．Molecularsystemafics，theoreticallyoI溏 lifromsystemat— ics，taxology，genetics，conlpal~tivebiochemistry，molecularbiologyandevolutionism，isaJ1importantmethodtostIldyphylosc~y，whichsup- portstobuildmoleculartreeOilthebasisofmolecules．Atpresent，thewaystobuildmoleculartreeare~axilnlltllPaIsi Method，Dis— tanoe．MatrixMethodsandM n啪 Likelihood．Computers0矗wal concerningsystemsarla1ysisareindudingMultipleSbqⅡeI1ceAllgnmcnt andPhylip，Pu e，Paup，Meag，Drlastar，Tx~eview，ClustaLx，Clustalw，LinuxandSOon． KeyW ords：phylogeny；molecularsystemafics；moleculartree；animal 着常速 】。所以用于系统进化时间的确立显然是不可靠的。 1 系统发育的概念及 目标 有两个事件使系统学研究产生了质的飞跃。1965年，Eucker． 系统发育(Phylogeny)是指任何分类单元的起源及进化关 kandl和 对人、牛、马的血红蛋 白(hemoglobin)氨基酸 系…。进行系统学研究最困难之处在于系统发育是一个漫 顺序比较研究中第一次发现，血红蛋白的氨基酸代换率在这 长的历史过程，人们无法完整记录及 目睹整个过程，因此，初 些物种的进化过程中保持一个常数。随后对其蛋 白研究也 期的系统发育关系的研究，都是利用与分类单元一起演化的 获得了相似的结果，尽管不同蛋白质具有不同的氨基酸代换 性状及化石等特征的分析比较来推断的。几百年来 ，众多的 率。与此同时，在群体遗传学领域，Kimura从扩散方程的引 科学家在这个领域进行了广泛而深入的研究 ，并且建立起基 入提出了分子进化中性理论 J。上述两事件为利用具有稳 于化石记录、表型性状和生理性状的系统发育关系。但是系