上海及周边地区猪圆环病毒2型基因型分析.pdfVIP

上海市畜牧兽医学会2011 年学术年会论文集  上海及周边地区猪圆环病毒2 型基因型分析 刘 健，周锦萍，王 建，鞠厚斌，张维谊，杨德全，刘佩红 （上海市动物疫病预防控制中心，上海 201103 ） 摘 要：采集上海及周边地区猪内脏样本，进行猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2,PCV-2 ）病原学检 测，并对阳性样本的ORF2序列进行分析和比对，发现发病猪群PCV-2 阳性率为39.06% （25/64 ），健康猪群 阳性率为13.51% （5/37 ），总的阳性率为29.70% （30/101 ）。30份阳性样本中PCV-2a亚型为2株，检出率为1.98 % （2/101 ），其余28株均为PCV-2b亚型，检出率为27.72% （28/101 ）。PCV-2 的ORF2序列与已登录的ORF2 序列的同源性在90.7%~100% 。2 株PCV-2a 株相互间的同源性为99.6% ；28 株PCV-2b 株的同源性在 94.4%~100% ，PCV-2b株中只有4株与已登录株DQ141322 、AY321984和AY484413株同源性关系最近，处于 同一分支中，而另外24株与Q151643 中国株同源性关系最近且处于同一分支中。研究结果表明上海及周边 地区PCV-2感染比较普遍，发病猪场的感染率远高于健康猪场，且感染率比往年有升高，PCV-2在猪场疫病 的爆发和传染中起着重要的协同作用；在PCV-2 的感染病例中，PCV-2b亚型为感染的优势毒株；绝大多数 PCV-2b ORF2 片段的同源性与已登录的一株中国株同源性关系密切，在基因进化树上处于同一分支，但是 否可以推断其为PCV-2的另一个亚型有待进一步考证。 关键词: 猪圆环病毒2型；基因型分析；PCV-2a ；PCV-2b MOLECULAR EPIDEMIOLOGY ANALYSIS ON PORCINE CIRCOVIRUS TYPE 2 IN SHANGHAI AND NEIGHBORING AREA LIU Jian, ZHOU Jin-ping, WANG Jian, JU Hou-bin, ZHANG Wei-yi, YANG De-quan, LIU Pei-hong （Shanghai Animal Disease Control Center , Shanghai 201103, China ） Abstract: Porcine Circovirus Type 2 was detected in porcine tissue samples from shanghai and neighboring area. The positive percentage of PCV-2 was 39.06% （25/64 ）in sick pigs, 13.51% (5/37) in healthy pigs, and 29.70% (30/101) in all samples. The results showed that the isolated rates of PCV-2a genotype and PCV-2b genotype were 1.98 % and 27.72%, respectively. Sequence analysis illustrated that nucleotide homologies of ORF2 of PCV-2a and PCV-2b isolates were 99.6% and 84.4%-100%, respectively, which were belonged to different groups. Out of 28 PCV-2b isolates, 24 isolates were belonging to one group with Q151643. this study revealed that in shanghai and neighboring area, PCV-2 infection was high prevalent, and infection rate in sick pigs was much higher