花生斑驳病毒青岛分离物cp基因序列克隆与分析.pdfVIP

花生斑驳病毒青岛分离物cp基因序列克隆与分析.pdf

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花生斑驳病毒青岛分离物cp基因序列克隆与分析 侯珊珊 刘媛媛 杨炳辉 崔小雯 长文程 高波 李向东 山东农业大学植物保护学院,泰安271018 摘要:利用RT-PCR从采自青岛市表现斑驳症状的花生样品 (QD5和QD6)中检测到了花生 斑驳病毒 (Peanutmottlevirus,PeMoV),克隆了其基因组3-端892bp的片段。核苷酸序列测定 与分析的结果表明,两个分离物的cp基因均为837bp,编码278个氨基酸,其中与蚜虫传毒相关 的基序为DAA。QD5和QD6cp基因与其他株系的核苷酸序列一致率分别为95.3%~99.2%和 95.6% ~ 99.4%,氨基酸序列一致率分别为93.5%~99.6%和93.5%~99.6%。系统进化分析 表明,PeMoV可以分为和地理其来源相关的3个组:美洲组、亚洲组和澳洲组。这是国内关于 PeMoV发生的首次报道。 关键词:花生斑驳病毒;cp基因;核苷酸一致率;氨基酸一致率;系统进化分析 CloningandSequenceAnalysisofthecpGenesofTwo PeanutmottlevirusIsolatesfromQingdao HOUShan-shan LIUYuan-yuan YANGBing-hui CUIXiao-wenCHANGWen-chengGAO BoLIXiang-dong ShandongAgriculturalUniversity,Taian 271018,China Abstract:Peanutmottlevirus(PeMoV)wasdetectedviaRT-PCRfromtwopeanutsamples(QD5andQD6)with mottlesymptomcollectedfromQingdao,ShandongProvince.The3-terminal892bpfragmentsofitsgenomewere clonedandsequenced.ThealignmentresultsindicatedthatthecpgenesofQD5andQD6were837bpinlengthand encoded278aminoacids,withDAAasthemotifregulatingaphidtransmission.ThecpgenesofQD5andQD6shared nucleotideidentitiesof95.3% ~ 99.2% and95.6% ~ 99.4% ,andaminoacididentitiesof93.5% ~ 99.6% and 93.5% ~99.6%,respectively,withthoseofotherPeMoVisolatesavailableintheGenBank.Thephylogenetic resultsshowedthatPeMoVareclusteredtothreegroups,America,AsiaandAustralia,whichareconsistentwith theirgeograohicalorigins.ThisisthefirstreportontheincidenceofPeMoVinChina. Keywords:Peanutmottlevirus;cpgene;nucleotideidentities;aminoacididentities;phylogeneticanalysis F干热灭菌 0min。取I 进行 序列 { ‘增的片段一

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