中国东北地区HIV%2fAIDS患者tat第一外显子基因变异特点及其二级结构变化和疾病进展关系的研究.pdfVIP

中国东北地区HIV／AIDS患者tat第一外显子基因变异特点及其二级 结构变化与疾病进展关系的研究 张岩 尚红·韩晓旭张曼刘静张子宁姜拥军刁莹莹代娣耿文清 (中国医科大学附属第一医院， 沈阳110001) 【摘要】 目的了解中国HIV／AIDS患者诅t第一外显子的基因序列及其二级结构的特征和 变异特点，探讨其与HIV-1感染者疾病进展之间的关系。方法选取40例辽宁和吉林HIV 感染后临床进程不同的人抽取外周血，提取核酸，用套式聚合酶链反应(PCR)扩增HIV-1 的tat基因，并进行核酸测序和二级结构预测分析。结果长期不进展者、无症状感染者及 AIDS患者的tat基因序列与相应亚型的国际流行株序列比较，各组均存在与流行株序列不 一致的氨基酸变异，而且某些变异具有组间特异性。二级结构预测分析未发现组间有明显差 异。在系统树分析中各组聚集在一起，呈混合分布。结论中国HIV／AIDS患者tat第一外显 子一些位点的基因变异可能与疾病进展有关，某些位点的基因变异可能会降低病毒的复制能 力；HIV感染后的疾病进展可能与tat蛋白的二级结构无明显关系。 【关键词】人类免疫缺陷病毒l型；tat基因：变异：亚型 The betweentheHIV／AIDS andthemutationand structure relationship progress secondary oftatexonl ZHANG Min，LIU Yan，SHANG Xiao—XU，ZHANGJing，ZHANG gene Hong，HAN Di，GENG 1鞋Affiliated Zi·ning，JIANGYong-jun，DIAOYing—ying，DAI Wen-qing．the Hospital ChinaMedical 11000 1，China University,Shenyang To thecharacteristicsofhuman virus(HIV-I) study immunodeficiency [Abstract]Objective as tatexonl mutationsandits structureHIV-1infectedinChina．So gene secondaryamong people to andthe We findthe betweenthetat mutationdisease relationship gene progression．Methods extracted DNAfromthewholeblood ofHIV-1carriersandAIDS PBMC genome samples patients． The oftheTatexonl were by chainreaction genesequences amplifiednest·polymerase were andthe structurewere (nest-PCR)．Productsdirectly,thesequencesse