通过文献挖掘建立乳腺癌相关基因关联网络地研究.pdfVIP

通过文献挖掘建立乳腺癌相关基因关联网络的研究★ 张朝林，张学工，马熹，李衍达 生物信息学教育部重点实验室／清华大学自动化系，北京，100∞4 摘要：已有的生物学文献中蕴涵了大量的有用信息，通过文 从序列分析逐步转移到对功能基因组学的研究，即 献挖掘对特定主题的文献进行分析，可以有效和有针对性的 探究基因的生物功能和揭示基因之间的相互关系上 将这些信息提取出来并进行整合，学习出新的知识。本文通 来。利用基因芯片技术【”l、蛋白质芯片技术16州等 过统计以乳腺癌为主题的PubMed文献摘要中基因的出现频高通量试验检测手段是进行功能基因组学研究的常 率，定义了一种表征基因相互关系的关联强度。基于关联强 用的方法。同时，运用文献挖掘技术在大量已经发 度对这些文献中所提及的基因聚类，构建各类的基因关联网 表的文献中提取、学习所需要的知识也是这一领域 络．使甩MD$实现了时络的在低维空间中的可视化，井详 中一个前景广阔的研究方向。 细分析了部分试验结果。分析发现这些关联网络具有明确的 近年来，分子生物学和遗传学迅猛发展，在相 生物意义．表明用文献挖掘技术和