苦荞Ft4CL基因克隆、生物信息学及分子进化分析.pdfVIP

J．SHANXIAGRlC．UNIV．(NaturalScienceEdition) 嘲 I学报(自然科学版)2o15．35(1)：24 OO3211 苦荞 Ft4CL基因克隆、生物信息学及分子进化分析 侯思宇h ，赵盖超 ，刘荣华 ，孙朝霞 ，令狐斌 ，韩渊怀 。，许冬梅 ，李红英 ’。 (1．山鹾农业大学 农学 院，山西 太谷 030801；2．农业生物工程研究所 ，山西 太谷 030801； 3．特色杂粮种质资源发掘与育种 山西省重点实验室 ，山西 太原 030031) 摘 要 ：与其他作物相 比，苦荞 中含有较高含量的黄酮类物质一 芦‘丁 ’。4一香豆酸一辅酶 A连接酶 (4一coumarate： CoA ligase，EC6．2．1．12)是植物苯 丙烷代谢途径转 向黄酮类物质代谢的关键酶之一 。本研 究利用 已知的来源于 九‘ 江苦荞 ’叶片的Ft4CL1(HQ654088)基 因片段为探针序列，从苦荞叶片转录组数据库 中序列拼接得到一个苦荞 Ft4CL 全长基因，命名为Ft4CL(GenBank登录号：KM362863)。生物信息学分析结果表明：该 cDNA长度为 2007bp，具有 完整的 0RF，共 1743bp，编码 580个氨基酸 ，具备 4CI所有活性位 点 。与 已公布 的部分 F CL基 因及蒺藜苜蓿 (Pb4CL)、甜瓜 (Cm4CL)和黄瓜 (Cs4CL)基 因相似度 为 100 、73 、73 和 72 。遗传聚类结果显示，该基 因归类于 双子叶植物 。研 究结果为深入探讨苦荞黄酮代谢途径提供 了基础 ，也为提高苦荞黄酮含量提供 了定 向靶基 因。 关键词 ：苦荞；4一香豆酸辅酶 A连接酶；电子克隆；生物信息学分析 中图分类号 ：Q781 文献标识码 ：A 文章编号 ：1671—8151(2015)01-0024—05 Cloning，BioinformaticsandMolecularEvolutionAnalysisofFt4CL in Fagopyrum Tataricum HouSiyu’ ，ZhaoGaichao’，LiuRonghua’，SunZhaoxia ，LinghuBin’，HanYuanhuai’ ，XuDongmei一， LiHongying ’’。 (1．CollegeofAgriculture，ShanxiAgriculturalUniversity，TaiguShanxi030801，China；2．InstituteoJ’Agricultural Bioengineer，ShanxiAgriculturalUniversity，TaiguShanxi030801，China；3．Sha~ iKeyLaboratoryofGeneticResources andBreedinginMinorCrops，TaiyuanShanxi030031，hC ina) Abstract：Comparedwithothercrops，buckwheatcontainshighercontentofflavonoids-- rutiff．4——coumarate：CoA lig— ase(EC 6．2．1．12)isoneofthekeyenzymesofplantphenylpropanesmetabolicpathwaytoflavonoid metabolism． BasedonthepartialsequenceofFt4CL1(HQ654088)previouslyclonedfromjiujiangbuckwheatleaves，anewandfull lengthFt4CL contigswasobtainedfrom screeningleaftranscriptomedatabaseandregisteredGenBankdatabaseinNC— BI(GenBanknumber：KM 362863)．BioinformaticanalysisresultshowedthatFt4CL cDNA as2007bp，withacom— pleteORF sequencesof1743bp，encoding580aminoacids，containedall