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生物数据仓库半结构化增量更新技术的研究与实现*)
and of
StudyImplementationS矗ni-structuredIncremental forBio-dataWarehouse
UpdatingTechnology
夏燕1邓绪斌1李岱1朱扬勇1·2
(复旦大学计算机与信息技术系 上海200433)1
(上海生物信息技术研究中心 上海200235)。
AbstractHowto data inbio-datawarehousehas
updatetimely inthecircum.
profoundpracticalsignificancetoday
stancesthatthebio-datais and
that datasourcescomeforth
increasingexponentiallyheterogeneous abundantly.This
studiesthe ofincrementalindatawarehouse.Asemi-structured
paper technology update incrementalrneth~
updating
odforBioDW,an bio-datawarehouse,isand
integrated bio-datasourceshavesuch
designedimplemented.Since
characteristicsas and methodusessemi—structuredformattostandardize
diversity,heterogeneitymutability,the
metadata,whichresolvesthe and of inbio-data
adaptabilityexpansibilityproblemstiming warehouse.1、he
update
methodcan data time-varianceofbio-data
improvequality,insure warehouse。andalsoestablishstablebasisforfur—
therresearchofbioinformaties.
Keywords update,Semi-structured
Bioinformatics,Heterogeneity,Incremental
数据仓库的灵活更新,已成为一项重要而迫切的研
1 引言
究课题。
在世界范围内众多研究机构的推动下,近十年 为解决上述问题,本文提出了数据仓库的半结
来,生物数据里指数级增长。迄今,可利用的在线生 构化增量更新方法,并在整合的生物信息数据仓库
物数据源已达500多个[1]。如何将它们整合起来, Bio-Dat
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