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生物数据仓库半结构化增量更新技术的研究和实现.pdf

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生物数据仓库半结构化增量更新技术的研究与实现*) and of StudyImplementationS矗ni-structuredIncremental forBio-dataWarehouse UpdatingTechnology 夏燕1邓绪斌1李岱1朱扬勇1·2 (复旦大学计算机与信息技术系 上海200433)1 (上海生物信息技术研究中心 上海200235)。 AbstractHowto data inbio-datawarehousehas updatetimely inthecircum. profoundpracticalsignificancetoday stancesthatthebio-datais and that datasourcescomeforth increasingexponentiallyheterogeneous abundantly.This studiesthe ofincrementalindatawarehouse.Asemi-structured paper technology update incrementalrneth~ updating odforBioDW,an bio-datawarehouse,isand integrated bio-datasourceshavesuch designedimplemented.Since characteristicsas and methodusessemi—structuredformattostandardize diversity,heterogeneitymutability,the metadata,whichresolvesthe and of inbio-data adaptabilityexpansibilityproblemstiming warehouse.1、he update methodcan data time-varianceofbio-data improvequality,insure warehouse。andalsoestablishstablebasisforfur— therresearchofbioinformaties. Keywords update,Semi-structured Bioinformatics,Heterogeneity,Incremental 数据仓库的灵活更新,已成为一项重要而迫切的研 1 引言 究课题。 在世界范围内众多研究机构的推动下,近十年 为解决上述问题,本文提出了数据仓库的半结 来,生物数据里指数级增长。迄今,可利用的在线生 构化增量更新方法,并在整合的生物信息数据仓库 物数据源已达500多个[1]。如何将它们整合起来, Bio-Dat

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