水稻基因设计育种的研究进展与展望.pdfVIP

水稻基因设计育种的研究进展与展望.pdf

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郭龙彪等 :水稻基因设计育种的研究进展与展望 完成的基础上,对有利基 因进行剪切 、聚合和改 良, 所有等位基 因的贡献率。通过 “基因精细定位 、等位 以培育在产量、品质、抗逆性等多方面都具有强优势 性差异评价以及表型鉴定”三者结合,为最佳利用优 的超级稻新品种ElO]。 异种质资源提供 了最有利途径 总之 ,“基 因设计育种”是指从基 因、表达 、细胞 最后 ,基于所有农艺性状有利基因的染色体位 层次上研究生物体 (农作物品种)所有成分的网络互 置、等位性差异和贡献率,育种家就可以设计聚合所 作行为和生长、发育过程及其对环境反应 的动力学 有有利等位基 因的超级基因型。当所有重要基因精 行为,并 了解其作用机制 ,继而使用各种 “组学”(基 细定位后,利用标记能精确选择重组个体 ,比较不 同 因组、转录组、蛋 白质组 、结构基因组 、代谢组、生理 有利等位基因。通过杂交系和标记选择特殊重组个 组、生物信息)数据 ,在计算机平台上建模、预测和验 体,借助软件工具选择 “获得所有等位基因聚合的最 证,构建出符合育种 目标的品种设计蓝图,最终结合 佳基 因型”设计方案 (图 1)。最终设计 出超级基因 育种技术实践(包括分子育种技术)培育出符合设计 型水稻品种后 ,再进行 田间表型评价。 要求的农作物新品种 。具体可 以分为 以下三步进 2 基因设计育种的背景技术和理论基础 行。 首先 ,通过构建分离遗传群体和导入系文库 分子标记辅助育种技术和水稻遗传转化技术是 (IL,introgression line),定 位所有 农 艺性 状 的 基因设计育种的两项最基本的技术 。分子标记辅助 QTL。为了定位与育种相关的所有性状 ,需要建立 选 择 (molecularmarker—assistedselection,MAS) 导入系文库 。每个导人系将多基因分离成一组单基 就是利用 目标基 因与某个分子标记紧密连锁 (即共 因位点/片段 ,减少多基 因的复杂性 ,消除复杂 的遗 分离)的关系,对 目标性状 的基 因型进行直接选 传背景对基因/QTL定位精度的不 良影响。用染色 择[13_l4];而遗传转化技术是应用 DNA重组技术, 单体片段系鉴定每个 目标性状位点的等位性变异和 将外源基因通过基因枪轰击法和农杆菌介导法导人 目标位点的精确位置。每个导入系又可作为下一世 植物基因组,直接获得外源基因稳定遗传和表达 的 代的起始材料 :含 目标位点的每个系再与轮 回亲本 植物遗传改 良体 l1【5-17]。除了以上两项技术外 ,目前 回交,构建高世代回交导入系的分离群体 ,鉴定重组 基因组辅助育种已成为水稻后基 因组时代的一个研 个体,高效定位重要农艺性状的基因/QTL。 究热点 。 连锁不平衡 (1inkagedisequilibrium,LD)定位 2.1 基 因组辅助育种技术 也是发现和定位影响 目标性状基 因/QTL 的方 基 因组 学 的发展 促进 了基 因组 辅 助育 种 法-[12]。LD定位依赖于表型和 目标位点附近 的多 (genome—assistedbreeding,GAB)技术 的形成和发 态性之间的关系。由于此法选择风险大,所以一般 展。基因组辅助育种是在基因组辅助或指导下形成 在 目标位点初定位 的基础上,再鉴定与 目标表型紧 的育种新理论和新方法,它是面 向基因组序列的育 密相关 的标记 (single—nucleotidepolymorphisms, 种策略。通过新发展 的全基因组分子检测技术 、虚 SNPs)或染色单体片段 ,这样可以精细定位 目标基 拟基因组设计技术

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