原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
辽宁大学学报 JoURNALoF uAoNING UNIvERsITY
自然科学版 NaturalSciencesE tion
第41卷 第3期 2014年 Vo1．41 No．3 2014
马铃薯贮藏蛋 白Patatin及其突变体分子动力学和分子对接 的研究
宋有涛 ，徐 姣 ，周 雷2，孙玉娜 ，周小红 ，张桥石 ，薛友林
(1．辽宁大学 生命科学院，辽宁 沈阳 110036；2．辽宁大学 环境学院，辽宁 沈阳110036；
3．辽宁大学 轻型产业学院，辽宁 沈阳 110036)
摘 要：马铃薯贮藏蛋白Patatin具有水解脂肪的能力 ，且特定位点的突变能够影响Patatin的水解酶活性 ．
Patatin的水解酶活性中心是由Ser77和Asp215组成 ，首先采用分子动力学方法研究 Patatin及其突变体的稳
定性和构象变化，通过结构 比对没有发现构象规律性的变化，然后采用分子对接方法，发现了两个基 团
(Patatin及其突变体活性位点Ser77的羟基与底物P一硝基苯基癸酯的酯键)问的距离具有规律性：即H109A
和D182A(活性减弱)两个基团之间的距离偏大，而R368A，E140A，H109N(活性增强)两个基团之间的距离
偏小，符合之前的生化数据 ．这说明Ser77的羟基与底物PNPCIO的酯键间的距离可能能够影响底物小分子
与Patatin蛋白的结合，从而影响Patatin酯酶的活性 ．同时，根据细胞内溶质磷脂酶A2(cPLA2)反应过程 ，
我们推测了Patatin与底物之间可能的催化机制 ． ，
关键词：Patatin；动力学模拟 ；分子对接；突变体 ；距离；酶活性 ；催化机制
中图分类号：Q754 文献标志码 ：A 文章编号：1000-5846(2014)03-0256-07
M olecularDynamicsandDockingStudieson
Potato StorageProteinPatatin andTtsSeveralM uatnts
SONG You—tao ．一，XU Jiao ，ZHOU Lei，SUN Yu—na ，
ZHOUXiao—hong，ZHANGQiao—shi，XUEYou—lin
(1．CollegeofLifeScience，LiaoningUniversity，Shenyang110036，China；
2．SchoolofEnvironmentalScience，LiaoningUniversiyt，Shenyang110036，China；
3．CollegeofLightIndustry，LiaoningUniversiyt，Shenyang110036，China)
Abstract： Patatinfrom potatohasthecapacityofhydrolasinglipidwiththecatalyticdyad
consistingofSer77 and Asp215．According to an early study，certain mutationswillaffectthe
activityofhydrolase．Inthisstudy，wehaveperformedmoleculardynamicssimulation(MD)to
investigatethestabilitiesandconformationalchangesofPatatinmutations．M D resultsrevealedthat
W T didnotshow distinctdifferencetoitsmutnatsinstability．Thedockingresultsrevealedthatthe
收稿 日期 ：2014—04—21
文档评论（0）