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PCR引物设计方法综述_尤超.pdfVIP

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PCR引物设计方法综述_尤超.pdf

农业基础科学 现代农业科技 年第 期 2011 17 PCR 引物设计方法综述 尤 超 赵大球 梁乘榜 周春华* (扬州大学园艺与植物保护学院,江苏扬州 225009 ) 摘要 为了获得PCR 引物设计的理想方法,笔者运用NCBI 等数据库与引物设计软件Primer Premier 5.0 等工具,结合引物设计的原 则,完成目的基因的引物设计,并对设计后的引物进行BLAST 比对、综合评价和基因的重新检测等分析,据此对PCR 反应条件进行优化研 究。结果表明,通过这些数据库和软件所设计的引物能基本满足后续的RT-PCR 反应,可以进行进一步的分子生物学研究。 关键词 PCR ;引物设计;软件;分子生物学 中图分类号 文献标识码 文章编号 ( ) S188 A 1007-5739 2011 17-0048-04 Review of the PCR Primer Design Method YOU Chao ZHAO Da-qiu LIANG Cheng-bang ZHOU Chun-hua * ( , , ) College of Horticulture and Plant Protection Yangzhou University Yangzhou Jiangsu 225009 , , Abstract In order to obtain an ideal method of PCR primer design the author completed primer design of target gene using some databases and , , , software tools for primer design such as NCBI Primer Premier 5.0 and so on combined with the principle of primer design.Then made a research on , optimization of conditions for PCR reaction after the designed primer was analyzed through BLAST comparison comprehensive evaluation and gene re- test analysis. The results indicated that primers designed through these databases and softwares could basically meet the requirements of following RT-

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