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最短路问题的闭环DNA算法.pdf

第 30 卷  第 3 期 系统工程与电子技术 Vol . 30  No . 3 2008 年 3 月 Sy st ems Engineering and Elect ronics Mar . 2008 ( ) 文章编号 : 100 1506X 2008 最短路问题的闭环 D NA 算法 1 ,2 1 ,2 2 2 周  康 , 同小军 , 刘文斌 , 许  进 ( 1. 武汉工业学院数理科学系 , 湖北 武汉 430023 ; 2 . 华中科技大学控制科学与工程系 , 湖北 武汉 430074)   摘  要 : 提出了不等长闭环 DNA 分子的概念 , 由此推广了闭环 DNA 计算模型 。给出了固定端点的最短路 问题闭环 DNA 算法 ,该算法首先对每条弧进行了三组 DNA 编码 ,再用有 目的的终止技术合成固定端点的所有 链 ,然后通过接入实验和电泳实验得到最短路 ,并通过检测实验输出所有最短路径 。得出了算法的复杂性 ,为说 明算法的有效性给出了一个算例 。最后讨论了最短路问题闭环 DNA 算法在变权网络 、自由终点或固定中间点的 最短路问题中的应用 ,并给出了相应的解决方法 。由此说明该算法具有广泛的适应性 。 关键词 : 闭环 DNA 计算模型 ; 最短路问题 ; 有 目的的终止技术 ; 接入实验 中图分类号 : TP 30 1. 6     文献标志码 : A Closed circle D NA algorithm of shortest path problem ZHOU Kang1 ,2 , TON G Xiaoj un1 ,2 , L IU Wenbin2 , XU J in2 ( 1. D ep t. of M at hem atics an d P hy s ics , Wuhan Poly technic Univ . , W uhan 430023 , China; ) 2 . D ep t. of Cont rol S cience an d Eng ineeri ng , H uaz hong Univ . of S cience an d Technology , Wuhan 4300 74 , China    A concept of closed circle DNA ’s different chainlengt h is brought forward , which generalizes a model Abstract : of clo sed circle DNA comp uting. For t he shortest pat h p roblem of fixed j umpingoff point and end point , a closed circle DNA algorit hm is put forward. In t he clo sed circle DNA algorit hm , t hree group s of DNA encoding for every arc

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