6株H9N2亚型禽流感病毒HA基因序列分析.pdfVIP

第二届全国禽病分子生物技术青年学者论坛论文集 6株H9N2亚型禽流感病毒HA基因的序列分析 陈瑞爱1一，张东霞3，徐家华3 (1．广东大华农动物保健品股份有限公司；2．华南农业大学兽医学院；3．肇庆大华农生物药品有限公 司省重点实验室) 摘要：为了掌握H9亚型禽流感病毒的变异情况，本研究选用本单位分离获得的6株H9N2亚型禽 流感病毒毒株，采用RT-PCR技术对其HA基因进行扩增、克隆和测序，并对所得的全序列进行测 序，分析其核营酸和推导氨基酸的同源性。结果显示，HC株和SN株在145位和313位出现新的潜 在糖基化位点，HZ株与FJ株在313位有潜在的糖基化位点，SS株在166位有新的潜在糖基化位点 出现。同源性分析结果显示，不同毒株HA核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为89．40／*-98．4％和 92．3％-99．1％：进化分析表明：分离毒株明显位于2个不同的组，SS株和LY株为同一组。 关键词；禽流感病毒；H9N2亚型；HA基因；序列分析 of GeneofSixH9N2AvianInfluenzaVirus the Analysis Sequence Hemagglutinin Chen Jia-Hua3 Rui．aiL2，ZhangDong-Xia3，Xu Animalhealth China (1．GangdongDahuanong products of Medicine：3．Zhao Medicines AgriculturalUniversityCollegeVeterinary QingDaHuaNongBiological CO．，LTD．) products Abstract：Inorderto the Genevariationof strainsH9N2avianinfluenza studyhemagglutinin H9N2，six viruswereisolmedandHA was and of RT-PCR,cloned gene amplifiedby sequenced．Thehomology nucleotideanddeducedaminoacidwere resultsshowthatnew sites analysised．The potentialglycosylation iSoccurredinHC strainsandSSstrainsat1 l 1 13andl strains，SNstrains，HZstrains，FJ 45，33，33，3 66， showedthatdifferentstrainsofHAnucleotide andaminoacid respectively．Homologyanalysis sequence was89．4％-98．4％and showedthat analysis sequencehomolo