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陆地棉农艺性状与SSR标记的关联分析.pdf

棉 花 学 报 CottonScience 2014.26(5):387~395 陆地棉农艺性状与SSR标记的关联分析 梁冰 ,范术丽 ,宋美珍 ,庞朝友 。魏恒玲。,喻树迅 1,2- (1.西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100;2.中国农业科学院棉花研究所 /棉花生物学国家重点实验室 河南 安阳455000) 摘要:利用关联分析方法以160对SSR引物对68份陆地棉品种2个播期组成的自然群体进行基因型检测.在 利用 STRUCTURE2.3.4软件分析群体结构的基础上,采用TASSEL4.0软件的GLM程序和MLM 程序对 17 个农艺性状进行关联分析。结果显示,STRUCTURE群体结构分析将 68份供试材料划分为3个亚群,基于 Nei’S遗传距离的聚类分析也将 68份供试材料划分为3个亚群,与群体结构划分结果基本一致 6个 SSR位点 均能通过GLM 和MLM程序检测到,且在2个播期下稳定出现,其中,CER0098.400与全生育期显著关联. DPL0375—250和HAU2414—147与果枝始节显著关联 ,DPL0504.135、HAU0883—120和NAU1298—524与衣分 显著关联。本研究结果为棉花分子标记辅助选择提供 了依据。 关键词:陆地棉;早熟性;产量性状;纤维品质;关联分析 中图分类号:$562.035.2 文献标志码:A 文章编号:1002—7807(2014)05.0387.09 AssociationAnalysisofAgronomicTraitsinUplandCottonUsingSSRMarkers LiangBing ,FanShuli,SongMeizhen,PangChaoyou,W eiHengling,YuShuxun (1.CollegeofAgronomy,NorthwestAFUniversity,Yangling,Shaanxi712100,China;2.InstituteofCottonResearch,CAAS/ StateKeyLabomtor)ofCottonBiology,Anyang,Henan455000,China) Abstract:Inthisstudy,68samplesofuplandcottonsowedontwodifferentdateswerescannedusing160pairsofSSRprimers toperformassociationanalysisof17agronomictraits,includingthoserelatedtoearlymaturity,yieldandfiberqualiyt,whichare mostlyquantitativetraits.STRUCTURE2.3.4softwarewasusedtoestimatethepopulationstrucutreofthe68varieties,which couldbedividedintothreesubgroups.ClusteranalysisbasedonNei’Sgeneticdistancewasalmostidenticaltothatthe68sam— plescouldbedividedintothreesubgroups.Usinggenerallinearmodel(GLM)andmixedlinearmodel(MLM)toperfomr asso— ciationanalysisbyTASSEL4.0software,sixSSR lociweredetectedatthetwosowingdates,ofwhichCER0098—400isex— tremelysignificantlyassociatedwithrgowthstage,DPL0375—250andHAU2414-147areextremelysignificnatlyassociatedwith locationofthefirstbranch,threeSSR loci,DPL0504—135,HAU0883—120andNAU1298—524,wereextremelysing ificantlyasso- ciatedwithlintpercentage.Thisresearchprovidesthebasesf

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