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陆地棉农艺性状与SSR标记的关联分析.pdf
棉 花 学 报 CottonScience 2014.26(5):387~395
陆地棉农艺性状与SSR标记的关联分析
梁冰 ,范术丽 ,宋美珍 ,庞朝友 。魏恒玲。,喻树迅 1,2-
(1.西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100;2.中国农业科学院棉花研究所 /棉花生物学国家重点实验室
河南 安阳455000)
摘要:利用关联分析方法以160对SSR引物对68份陆地棉品种2个播期组成的自然群体进行基因型检测.在
利用 STRUCTURE2.3.4软件分析群体结构的基础上,采用TASSEL4.0软件的GLM程序和MLM 程序对 17
个农艺性状进行关联分析。结果显示,STRUCTURE群体结构分析将 68份供试材料划分为3个亚群,基于
Nei’S遗传距离的聚类分析也将 68份供试材料划分为3个亚群,与群体结构划分结果基本一致 6个 SSR位点
均能通过GLM 和MLM程序检测到,且在2个播期下稳定出现,其中,CER0098.400与全生育期显著关联.
DPL0375—250和HAU2414—147与果枝始节显著关联 ,DPL0504.135、HAU0883—120和NAU1298—524与衣分
显著关联。本研究结果为棉花分子标记辅助选择提供 了依据。
关键词:陆地棉;早熟性;产量性状;纤维品质;关联分析
中图分类号:$562.035.2 文献标志码:A
文章编号:1002—7807(2014)05.0387.09
AssociationAnalysisofAgronomicTraitsinUplandCottonUsingSSRMarkers
LiangBing ,FanShuli,SongMeizhen,PangChaoyou,W eiHengling,YuShuxun
(1.CollegeofAgronomy,NorthwestAFUniversity,Yangling,Shaanxi712100,China;2.InstituteofCottonResearch,CAAS/
StateKeyLabomtor)ofCottonBiology,Anyang,Henan455000,China)
Abstract:Inthisstudy,68samplesofuplandcottonsowedontwodifferentdateswerescannedusing160pairsofSSRprimers
toperformassociationanalysisof17agronomictraits,includingthoserelatedtoearlymaturity,yieldandfiberqualiyt,whichare
mostlyquantitativetraits.STRUCTURE2.3.4softwarewasusedtoestimatethepopulationstrucutreofthe68varieties,which
couldbedividedintothreesubgroups.ClusteranalysisbasedonNei’Sgeneticdistancewasalmostidenticaltothatthe68sam—
plescouldbedividedintothreesubgroups.Usinggenerallinearmodel(GLM)andmixedlinearmodel(MLM)toperfomr asso—
ciationanalysisbyTASSEL4.0software,sixSSR lociweredetectedatthetwosowingdates,ofwhichCER0098—400isex—
tremelysignificantlyassociatedwithrgowthstage,DPL0375—250andHAU2414-147areextremelysignificnatlyassociatedwith
locationofthefirstbranch,threeSSR loci,DPL0504—135,HAU0883—120andNAU1298—524,wereextremelysing ificantlyasso-
ciatedwithlintpercentage.Thisresearchprovidesthebasesf
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