胃癌不同转移能力细胞系的2-DE图谱及差异分析.pdfVIP

维普资讯 临床与实验病理学杂志 JClinExpPathol2006Feb；22(1) ·81· 胃癌不同转移能力细胞系的2-DE图谱及差异分析 谢海龙 ，周晓军 ，陈主初 摘要：目的 建立 胃癌低转移能力细胞系RF一1和高转移能力细胞系RF-48的2-DE图谱 ，并分离胃癌转移相关蛋白质。方法 利用固相pH梯度技术 (immobilizedpHgradient，IPG)双向凝胶电泳 (twodimensioanlpolyacrylamidegelelectrophoresis，2-DE) 建立 胃癌低转移能力细胞系RF一1和高转移能力细胞系RF-48二维电泳图谱 ；采用图像分析软件进行比较分析，识别差异表达 的蛋白质，分离胃癌转移相关蛋白质。再利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF—MS)及数据库查询 ，对部分 差异表达蛋白质点进行鉴定。结果 建立 胃癌低转移能力细胞系RF一1和 胃癌高转移能力细胞系RF-48双向凝胶电泳图谱 ； 三块凝胶的平均蛋 白质点数分别为 960±92和978±83，平均匹配的点数分别为 780±69和769±53，匹配率达 87％和 86．3％；对25个差异蛋白质点进行肽质指纹图分析，鉴定出与瘤基因、细胞周期调控和信号转导有关的蛋白质。结论 建立 分辨率高且重复性较好的人 胃癌低转移能力细胞系RF一1和 胃癌高转移能力细胞系RF-48的双向凝胶电泳图谱 ，可以识别和 鉴定出一些与胃癌转移相关的差异表达蛋白质。 关键词：胃肿瘤；蛋 白质组 ；转移；细胞系 中图分类号：R735．2 文献标识码：A 文章编号：1001—7399(2006)01—0081—04 2-DE profilinganddifferentialanalysisofhighlyandpoorlymetastatichumna gastriccarci· nomacelllines XIEHai—long，ZHOUXiao-jun，CHENZhu—chu (DepartmentofPathology，NanjingGeneralHospitalofNanjingMilitaryCommand，Nanjing 210002，China；Laboratoryof Tumor CellBiology，CancerResearchInstitute，XiangyaMedicalSchoolCentralSouthUniversity，Changsha 410078，hCina ) Abstract：Purpose Toestablishtwo—dimensionalelectrophoresisprofileswithhi．ghresolutionandreproducibilityfrom RF一1cellline (primarytumorofagastricadenocarcinomapatient)nadRF-48celllineitsmetastaticcounterpart，andtoidentifygastricadenocarci— nomametastasisrelatedproteins．Methods ImmobilizedpH rgadient—twodimensional polyacrylamidegelelectrophoresis，silverstai— ning，PDQuest2-DEsoftwareanalysis，peptidemassfingeprrintingbasedonmatrix—assistedlaserdesoprtion／ionizationtimeofflight massspectrometry(MALDI—TOF—MS)nadSWISS—PROTdatbaasesearching。wereusedtoseparatenadidentifythedifferentialpro— teomicexpressionsbetweenRF一1celllineandRF-48cellline．Results Thegood2-DEpatternbetweenRF一1celllineandRF-48cell line，includinghighresolutionandreproducibilityWas obtai