共同祖先原则与系统发育树的解读.pdfVIP

14 生物学通报 2008年第43卷第9期 共同祖先原则和系统发育树的解读 韩凤侠(4警／g师范大学生命科学学院上海‘200062) 摘要 系统发育树是基于共同祖先原则，用于描述生物传代谱系的常用表达方式，可以直 观地表达分类群(物种或基因)之间的亲缘关系和进化方向，但这两方面在生物学研究和教学 中却常常被误读。通过具体实例，阐释了如何应用共同祖先原则正确解读系统发育树的方 法。 关键词 系统发育树进化 共同祖先原则 中国图书分类号：Qll 文献标识码：A 通过系统发育树来推断生物之间的亲缘关 述的误读现象忽视了这一最基本原则。 系。是现代生物学研究的基本方法。树的理念 (tree—thinking)已经被广泛地应用于物种间的同源 性分析和生物进化历史的推导．甚至在鉴定某些 致命性病毒f如HIV)的来源、追溯传染时间的起点 以及病毒潜在的传播途径等方面，也能发挥重要 作用。作为生物学跨学科研究的常用工具，系统发 ^ 育树也是评估进化证据的重要依据。正确理解系 统发育树所表达的生物学意义．对于分析和判断 物种间的亲缘关系和进化方向都是极为重要的。 但是．在生物学研究和教学中。还普遍存在对系统 发育树误读的现象。 以图lA为例，通常有2种典型的误读现象。 廿 一种是在读图时经常会因为鳄鱼和蜥蜴在外形上 图1 基于多基因序列构建的脊椎动物 代表类群的系统发育关系 跟鸟相比较拥有更多的相似之处．主观上认为鳄 关于依据共同祖先原则判断分类群间的亲缘 鱼和蜥蜴之间的亲缘关系应该比它和鸟的亲缘关 关系远近，可以通过某一家谱为例来理解(图2)： 系更近：另外一种误读现象是将对进化史的错误 图中的15和17是堂兄弟关系。15和19的父辈 理解带人对树图的分析中．例如把人看作是由猿 是堂兄弟关系，因此，可以很容易看出15与17之 猴进化而来的。或者把鳄鱼看作是由蜥蜴进化而 间的亲缘关系要比15与19的亲缘关系更近．因 来的．从而把物种间的进化简单地看成了一种由 为15和17的共同祖先是位于第2代的3和4． 低级到高级的线性排列关系。但当看到与图1A 而15和19的共同祖先是则是位于第1世代的1 所表达生物学意义相同的图lB，又会疑惑这些看 和2。由此可以看出，系统发育树所表达的是物种 法可能是不对的? 之间的历史关系，而不是相似性的关系。尽管近缘 正确解读系统发育树所表达的生物学意义， 首先应该理解进化理论的基本原则——共同祖先 物种间倾向于彼此相似，如果它们之间在进化过 程中进化速率不一致的话，则相互之间形态上的 原则。早在1859年，达尔文在《物种起源》一书中 差别就会很大。前面提到鳄鱼、蜥蜴和鸟之间亲缘 就指出，尽管生物界各物种的表现形式和生活方 关系的比较．虽然鳄鱼在外部形态上与蜥蜴更近， 式不同，它们都是由共同的祖先分化而来的，这是