低磷胁迫水稻根部基因表达谱的研究.pdfVIP

中国科学 C 辑 :生命科学 2009 年 第 39 卷 第 6 期 : 549 ~ 558 SCIENCE IN CHINA PRESS 低磷胁迫水稻根部基因表达谱研究 李利华, 邱旭华, 李香花, 王石平, 练兴明* 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室, 国家植物基因研究中心, 武汉 430070 * 联系人, E-mail: xmlian@ 收稿日期: 2009-01-06; 接受日期: 2009-04-30 国家重点基础研究发展计划(批准号: 2005CB120905)资助项目 摘要 磷是植物体内重要的营养元素. 土壤中含磷总量丰富, 但能被植物直接吸收利用的可溶 关键词 性磷含量却很低, 这成为制约农作物产量的重要因素. 本研究利用水稻寡核苷酸芯片分析了水稻 磷 根部在正常营养条件和低磷胁迫6, 24, 72 h 3 个时间点的全基因组表达谱. 和正常营养条件下相 水稻 比, 低磷胁迫水稻根部共发现795 个差异表达基因. 差异表达基因功能分析发现: (1) 磷酸盐转运 芯片 表达谱 蛋白、酸性磷酸酶、RNA 酶等基因上升表达; (2) 糖酵解等与能量代谢相关基因先上升后下降表 达; (3) 氮吸收和脂代谢相关基因改变其表达; (4) 蛋白质降解、细胞衰老相关基因上升表达; (5) 部分跨膜转运蛋白基因表达上调. 研究结果为进一步揭示植物低磷胁迫反应机制, 改善作物对磷 吸收利用效率提供了有用的信息. 磷是植物体内一系列重要物质的组成成分, 核 号以及植物体适应低磷的具体调节机制, 目前尚不 酸、蛋白质、磷脂、植酸、ATP 和含磷酶等都离不开 十分清楚. 磷的存在. 磷矿是一种不可再生的自然资源, 据估计 随着功能基因组学研究的不断深入, 基因表 按目前的开采速度, 60~90 年以后, 世界上的磷矿资 达谱研究在植物抗病[23] 、非生物胁迫[24,25] 、低氮营 源将会枯竭[1]. 养[26,27] 、低磷营养[28~31]等方面取得了一定的进展. [2~5] 植物体在低磷胁迫下, 根构型会发生改变 , 本研究所用水稻(Oryza sativa)寡核苷酸芯片由 有机酸分泌增加[6,7], 同时一些基因, 如磷酸盐转运 北京华大基因研究中心提供 . 该芯片 BGI-Rice- 蛋白[8~10] 、酸性磷酸酶[11,12] 、RNA 酶[13,14]等的基因的 Chip30K 由6 万个基因特异的寡核苷酸片段(70 mer) 表达表达都加强. 低磷胁迫还会诱导体内代谢副通 点在两张玻片上. 本实验研究了水稻根部在低磷胁 [15,16] 路的形成 . 迫和正常营养条件下表达谱的差异, 希望能够更进 真核生物酵母中磷调节元件可以调节一系列 一步揭示水稻适应低磷环境的生物学机制. 低磷反应基因的表达 [17,18]. 在拟南芥(Arabidopsis 1 材料和方法 thaliana) 中一个对低磷信号传导起重要作用的 PHR1 基因, 属于 MYB 类转录因子, 它