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R研究综述 研究综述
EVlEWS R EVlEWS
T - RFLP 技术及其在微生物群落结构研究中的应用
T - RFLP technique and its application in research on microbial com-
munity structure
1 2 1
贾俊涛 , 宋林生 , 李 筠
( 中国海洋大学海洋生命学院 山东青岛 中国科学院海洋研究所 山东青岛 )
1. 266003 ; 2 . 266003
中图分类号: 文献标识码: 文章编号: ( )
Q919 . 9 A 1000 - 3096 2004 03 - 0064 - 05
微生物是生态系统的重要组成部分,在各种元素 ( 变性梯度凝胶
denaturing gradient gel electrophoresis ,
[3 ,4 ]
的生物地化循环中起关键作用。因此研究微生物的群 电泳法)有更高的灵敏度 ,比构建 16SrDNA 克隆文
落结构,借此了解微生物和环境的关系就尤为重要。 库和RFLP 分析工作量少很多。
长久以来微生物群落结构的调查方法一直是建立在 1 原理方法
分离和培养的方法上。这种方法不但费时费力,而且
不够准确。这反映在如下几个方面:()微生物群落组
1 首先根据比较基因组学的研究结果选取一段具
成极度复杂,有报道称,每30 g 土壤中含有4 000 多 有系统进化标记 ( )特征的 序
phylogenetic marker DNA
[1 ]
种微生物 ,因而采用传统方法工作量巨大。()反应
2 列作为目的分析序列。目前, 基因( ) 是
16S rRNA rDNA
结果的阳性阴性有时不好判断,容易产生偏差。()培
3 最常用的作为细菌群落结构分析的系统进化标记分
养的方法对菌有选择性。 环境中的绝大多数微生
4 . 子。从 年代初开始, 分析了大量菌的
70 Carl Woese
物是不可培养的 可培养的微生物只占总量的
,
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