基因芯片筛选成釉细胞瘤差异表达基因的研究.pdfVIP

维普资讯 中国病理生理杂志 ChineseJournalofPathophysiology 2008，24(5)：992—996 [文章编号] 1000—47l8(2008)05-0992一o5 基因芯片筛选成釉细胞瘤差异表达基因的研究 蒋立坚 ， 赖仁发 ， 李卫国 ， 吴新中 ， 蔡道章 (中山大学附属第三医院 口腔科 ，骨科；暨南大学附属第一医院口腔科，广东 广州510630) [摘 要] 目的：用生物芯片技术筛选成釉细胞瘤相关基因。方法：分别从人成釉细胞瘤和 l6周人类胚胎 的牙胚组织中提取总RNA并纯化为mRNA，2种组织的mRNA分别逆转录合成有荧光分子标记的探针，然后与含 有14000种人类基因的芯片进行杂交 ，杂交信号用ScanArray4000StandardBioehipScanningSystem扫描仪扫描。结 果用芯片图像分析软件 (GenepixPro3．0)进行分析。结果：经过杂交筛选并与人类胚胎牙胚组织 比较，从 14000 个基因中筛选出差异表达基因722个 ，占5．O％，大于2倍的上调基因有24O个 (33．O％)，其中有92个基因表达超 过3倍；下调基因482个 (67．O％)。结论：运用基因表达谱芯片可以初步筛选出成釉细胞瘤相关基因。 [关键词] 成釉细胞瘤；基因表达；寡核苷酸序列分析 [中圈分类号] R739．82 [文献标识码] A Differentialexpressionsofameloblastoma related genesdetermined by m tcroarray JIANGLi—j!an，LAIRen—fa，LIWei—guo，WUXin—zhong，CAIDao—zhang (DepartmentofOralandMaxiUofacialSu~ery，DepartmentofOrthopeoicSurgery，tkThird够 z Hospital，SunYat— sellUniversity3DepartmentofOraland MaxillofacialSurgery，tk First够 Z Hospital，．~nanUniversity，Gunngzhou 510630，China．E—mail：daozhang@medma il．corn．cn) [ABSTRACT] AIM：Thisstudyaimstoscreenthedifferentiallyexpressedgenesrelatde tothepahtogenesisof ameloblastomabycDNA microarray．M ETHODS：ThetotalRNAswere isolatedfrom ameloblastomanadtooht germ 。re． spoctively．TheRNAswerepurifiedbyoligotex．Boht themRNAsfrom twokindsoftissueswere reve~elytranscribedto cDNA wiht hteincorporationoffluorescent—labelleddUTPtopreparethehybridizationprobes．Themixde probeswere hy- bridizedtocDNA microarray．Tumor— relatde geneswerescreende through htenaalysisoffluroescentintensity．RE- SULTS：722genesexhibitde significnatchnagesinexpressionlevelsinhteameloblastomaincomparisonwiht tooht gemr s fi~ues．24Ogeneswereoverexpressde morethna doubled(92genesweremorehtan3一fold)，nad482geneswereunder-