土壤微生物群落多样性研究方法及进展.pdfVIP

维普资讯 藐 。r iAg生ri。 B乱s羔 2J0u0n8e年，2600月8 文章编号；1008—3464(2008)增一0084一O5 土壤微生物群落多样性研究方法及进展 姚晓华 (广西大学 农学院，广西 南 宁 530005) 摘要：微生物多样性是指群落中的微生物种群类型和数量、种的丰度和均度以及种的分布情况。研究 土壤微生物群落多样性的方法包括传统的以生化技术为基础的方法 (直接平板计数、单碳源利用模式等) 和以现代分子生物技术为基础 的方法 (从土壤 中提取 DNA，进行 G+C 含量 的分析，或杂交分析 ，或进 行 PCR，产物再进行 DGGE／TGGE等分析)。现代生物技术与传统微生物研究方法 的结合使用，为更全面 地理解土壤微生物群落的多样性和生态功能提供了良好的前景。 关键词 ：微生物多样性 ；生化技术 ；分子生物学技术 ；DNA 中图分类号：．Q938．15 文献标识码 ：A Advancementofmethodsin studyingsoilmicrobialdiversity YA0 Xiao—hua (CollegeofAgriculture，GuangxiUniversity，Nanning530005，China) Abstract：Species diversity consistof speciesrichness，the totalnumber ofspecies，species evenness，and the distribution ofspecies． Methodsto measuremicrobialdiversity in soilcan be categorized into two groups：biochemical—based techniquesand molecular—based techniques． The formertechniquesincludeplatecounts，solecarbonsourceutilizationpatterns，fattyacidmethylester analysis， and et a1．The latter techniques include G + C ， DNA reassociation， DNA—DNA hybridization，DGGE／TGGC，andeta1．0verall，thebestwaytostudysoilmicrobialdiversitywould betouseavarietyoftestswith differentendpointsanddegreesofresolutiontoobtain thebroadest picturepossibleandthemostinformationregardingthemicrobialcommunity． Key words：microbialdiversity； biochemical—based techniques，molecular-based techniques， DNA 微生物多样性研究是微生物生态学最重要的研究内容之一 。微生物在土壤中普遍存在，对环境条 件的变化反应敏捷 ，它能较早地预测土壤养分及环境质量的变化过程，被认为是最有潜力的敏感性生 物指标之一L1]。但土壤微生物的种类庞大，使得有关微生物区系的分析工作十分耗时费力 。因此，微 生物群落结构的研究主要通过微生物生态学 的方法来完成，即通过描述微生物群落的稳定性 、微生物 群落生态学机理以及 自然或人为干扰对群落产生的影响，揭示土壤质量与微生物数量和活性之间的关 系。利用分子生物学技术和研究策略，揭示 自然界各种环境中 (尤其是极端环境)微生物多样性的真 实水平及其物种组成，是微生物生态学各项研究的基础和核心，是重新认识复杂的微生物世界的开 端。 收稿