中华鳖线粒体遗传变异的细胞色素b序列分析.pdfVIP

广东农 科学 2011年第 2期 5 中华鳖线粒体遗传变异的细胞色素b序列分析 余帆洋，章 群 ，唐优 良周佳怡 (暨南大学水牛生物研 究所 ，广东 广州 510632) 摘 要 ：测定并分析 了长 江水系 l4尾中华鳖 ( discussinensis)的线粒体 细胞色素 b基因 1140bp序 列 ，结合 GenBank中下载的 3 个序列 发现 了243个 变异位点 ，61个简约信息位 ih-、；A+T含量 (60．6％)明显 高于 G+C含量(39．4％)；17个 中华鳖序列中共存在 1O个单倍 型 ．单倍型多样性fd)为 O．882，核苷酸多态性f)为 O．01002。在分子系统树上 ，l7个样本共形成 3个谱 系，其 中K江 中下游m现遗传距离 为 0．023的2个谱系．谱系 A 由7个单倍 型 (共 l4尾 )组成 ，谱 系 c 由2个单倍型 (共 2尾)组成。韩国 1尾单独为谱 系 B，与 A、c谱系之 问 的遗传距离分删为 O．030、0．031。推测 3个谱系问分化时间约为 5百万年 ，建议分别加 以保护。长 江中下游不 同地理来源 的个体混杂分布 ， 没有形成明显的地理聚群 ． 同群体间的遗传变异大 丁群体 内的遗传变异 中性检测Tajima’sD和 Fu’sFs均为显著负值 ，核苷酸不对称 分布分析呈多峰型 ．表明中华鳖未经历过种群扩张 。 关键词 ：中华鳖 ：细胞色素b；遗传变异 中图分类号 ：O173 文献标识码 ：A 文章编号 ：l004—874X(2011)02—0005—03 Preliminarystudyongeneticvariation ofmitochondrial DNA cytochromebgeneofPelodiscussinensis YUFan-yang，ZHANGQun，TANGYou—liang，ZHOUJia—yi (Instituteofh’drobiology， nnnUniversity，Gucmgzhou510632，China) Abstract：SequencesofCompletemitoehondrialDNA Cytoehromeb geneofPelodiscussinensisin YangtzeRiverweresequenced and analyzedinpresentstudy．Combinedwithhomologoussequencesdownloadedfrom GenBank，243variablesitesand6lparsimony—informatiesites werefoundintile1140bpsequences，andA+Tcontent(60．6％)weremorehigherthanG+Ccontent(39．4％)．Totallythereexisted10haplotypesof 17samplesinYangtzeRiver,andhaplotypediversity(Hd)was0．882，nucleotidepolymorphism ㈣ wasO．01002．IntheNeighbor_joiningtree3 lineageswererecovered，ofwhichgeneticdistancebetween linageA composed of7 haplotypesfrom 14 individualsandlinageC contained 2 haplotyesfrom 2individualsfound intheYangtzeRiverwereO．023．andLineageC representedbysingleturtlewerefrom South Korea．andthe