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- 2015-08-26 发布于重庆
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青霉素_头孢菌素分子结构与抗菌活性的关系.pdf
Ch em ica l R e search an d A pp licat ion
1997 年第 9 卷第 5 期 V o l. 9 N o. 5 1997
青霉素、头孢菌素分子结构与抗菌活性的关系
张士国 李 红 张向东
(滨州师专化学系 滨州 256604) (辽宁大学化学系 沈阳 110036)
杨 频
( 山西大学分子所 太原 030006)
关键词 内酰胺抗生素 构效关系 分子力学 量子化学计算
以前对 内酰胺抗生素的构效关系已做了大量研究[ 1, 2 ] 。关于 内酰胺抗生素具有活性的
[3 ]
结构 早就指出 是由于 内酰胺中内酰胺氮原子的化学键不是平面结构, 即氮原
W oo dw ard
( )
子伸出与其相连的三个原子所在平面某一高度 称为 内酰胺的锥度 , 使酰胺键有较大的张
( )
力, 易受亲核试剂的进攻而与受体 青霉素作用蛋白等 作用, 过去对锥度与活性关系的研究都
着眼于不同类型的 内酰胺之间, 这样就可能掺杂着其它因素的影响, 不便于搞清锥度与活性
的关系。本文用分子力学和量子化学计算, 以分子力学设计母核相同的 内酰胺分子的不同构
象来研究分子的结构与反应活性、抗菌活性的关系, 以期给出影响它们反应活性、抗菌活性的
本质因素。
研究方法
分子力学计算使用MM PM 程序, 量子化学计算使用CN DO 2 程序, 计算所需分子的结
[4, 5 ] [ 6 ]
构数据取自它们的晶体构象坐标 , CN DO 2 计算中的能量参数取 自文献 , 为了减少计算
量而不失计算结果的准确性, 对分子在保持母核不变前提下进行了简化, 简化后的模型在图 1
示出。
图 1 本文中涉及到的化合物模型(R = R ′= H )
本文于 1996 年 12 月 3 1 日收到, 1997 年 1 月 30 日收到改稿
第 5 期 张士国等: 青霉素、头孢菌素分子结构与抗菌活性的关系 50 1
结果与讨论
1. 青霉素和 3 头孢菌素的构象与锥度: 用分子力学方法, 控制锥度变化, 即在保持一定
( )
锥度的条件下, 优化 、 的构象和能量 表 1 。对于模型 、, 我们选择其能量最低的构象时相
a b a b
对张力为 0, 相对张力(E s ) 随锥度变化的情况在图2 中示出。
图2 和 的相对张力能( s ) 随锥度( ) 的变化曲线
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