DNA及组成碱基和含氮有机小分子间的相互作用的分析.pdfVIP

摘 要 脱氧核糖核酸(DNA)是基本的生命物质，对一切生命现象都起着至关重 要的作用。在分子水平上阐明这些生物大分子与小分子、离子，特别是药物分子 的相互作用是当前生命科学、临床医学、药物化学及化学等众多领域的重要研究 课题。本论文主要研究了脱氧核糖核酸(DNA)及其组成碱基与含氮有机小分 子的相互作用，其主要内容由三个部分组成。 本论文第一部分阐述了近年来在生物大分子DNA与小分子相互作用研究领 域的研究进展情况，归纳了生物大分子DNA与小分子相互作用的方式及特点， 总结了研究它们相互作用的所采用的各种方法及仪器，分析了该研究对生物、医 学及化学上的重要意义。 第二部分我们在LKB～2275型生物活性检测仪上采用等温滴定微量热法 (ITC)在298，2K条件下研究了DNA组成碱基腺嘌呤、嘌呤、脱氧腺苷、脱氧 核糖、嘧啶等主体分子与含氮小分子(乙胺、正丙胺、正丁胺、正庚胺、二乙胺、 三乙胺、二丁胺、三丁胺、环己胺、苯胺、乙酰胺、丙稀酰胺等)的相互作用， 得到了它们相互作用的结合位点数、结合常数等结合参数和相互作用焓变、相互 作用Gibbs自由能变化和相互作用熵变等热力学参数。发现所得的腺嘌呤、嘌呤 与含氮小分子的相互作用参数和脱氧腺苷、脱氧核糖、嘧啶的有着很大的差别。 通过分析这些相互作用的数据分析，得到含氮小分子与腺嘌呤、嘌呤发生相互作 用时主要作用在腺瞟呤、嘌呤的9位上的氮原子这一重要结论。同时，我们也测 定了正庚烷、正己烷与腺嘌呤、嘌呤、脱氧腺苷、脱氧核糖、嘧啶等主体分子的 相互作用各种结合参数和热力学参数，比较了烷基胺和正庚烷、正己烷与主体分 子相互作用的不同，得出了烷基胺是通过分子中的一NH2基团中的氮原子与腺嘌 呤、嘌呤等等主体分子发生相互作用的这一结论，对含氮药物的设计和研究具有 指导意义。我们提出了烷基胺通过分子中的氮原子与腺嘌呤、嘌呤的9位氮原子 发生相互作用的模式和影响该相互作用的有关客体分子的因素。研究中发现含氮 小分子在与主体分子发生相互作用时主要受到烷基胺的碱性、空间位阻效应以及 烷基胺本身的疏水亲脂相互作用的影响。共轭效应和空间位阻效应的存在大大减 弱了这种相互作用，而巯水亲脂相互作用加强了它们之间的相互作用。 除了采用等温滴定微量热法外，我们也使用了混合流动微量热的方法研究了 正丙胺、正丁胺、正庚胺等小分子的相互作用，得到了不同温度下它们的相互作 用焓变，从而求得了腺嘌呤与烷基胺分子的相互作用热容，证明了疏水亲脂作用 的存在。 此外我们也应用了紫外可见光谱法研究了腺嘌呤、嘌呤、脱氧腺苷、嘧啶等 主体分子(脱氧核糖无紫外吸收峰)与正庚胺、正庚烷的相互作用。发现正庚胺 的加入使腺嘌呤、瞟呤的吸收峰发生了移动，而脱氧腺苷、嘧啶的吸收蜂没有发 生变化。而正庚烷的加入没有引起任何主体分子的峰的位置移动。这也证实了烷 基胺通过分子中的氮原子与腺嘌呤9位氮原子发生相互作用的这一结论。 第三部分，我们也采用了等温滴定微量热法(ITC)研究了脱氧核糖核酸 (DNA)与含氮有机小分子的相互作用，得到了它们相互作用的结合位点数、 结合常数等结合参数和相互作用焓变、相互作用Gibbs自由能变化和相互作用熵 变等数据。通过对它们进行分析和与腺嘌呤、嘌呤的与小分子相互作用数据进行 比较，得到了烷基胺等小分子在与DNA作用时也是通过分子中的--NH2基团， 并且发现这种相互作用受到烷基胺中氮原子周围基团的空间位阻效应的影响，同 时如果烷基胺的氮原子可以与其它基团形成共轭体系则减弱了这种相互作用。但 是烷基胺等小分子与DNA的具体作用部位及方式仍然需要进一步研究。 本研究工作通过改变一系列主体和客体，应用等温滴定微量热法、混合流动 微量热法和紫外可见光谱法研究它们的相互作用，测得了各种结合参数和相互作 用热力学参数，并且得到了烷基胺通过氮原子与腺嘌呤的9位氮原予发生相互作 用的这一重要结论，这对小分子与生物大分子DNA的相互作用的具体结合部位 研究具有重要意义，具有一定的创新性。 关键词 等温滴定微量热法 混合流动微量热法 紫外可见光谱法 腺嘌呤 烷基胺 脱氧核糖核酸(DNA) 2 ABSTRAC