人类miRNA控因子及靶基因的基因本体分析.pdfVIP

中文摘要 转录后沉默【l】。miRNA通过作用于多个靶基因在很多信号通路，如发育、分化、 增殖、细胞凋亡中发挥重要作用【2】。同时，其自身表达还受到Iji『体转录因子的调 控，在人类正常组织和肿瘤细胞系中均存在组织特异性的表达模式【3．4】。从而组 成miRNA上下游，复杂调控网络回路。 本研究利用基因本体(Gene 别对382个miIⅢA的上游转录因子和下游靶基因参与的生物学过程，行使分子 功能和细胞组分构成三个方面做聚类分析。分析结果显示，miIⅢA的“转录因 子／转录因子和“靶基因／靶基因之间，存在着广泛的正、负相关关系， 提示它们之间可能存在协同或拮抗作用。特别地，我们还发现一类“转录因子／ 靶基因”之间的相关性，提示转录因子可能通过miRNA，影响相关基因的表达。 情况，从而间接地影响某些生物学过程。 Ontology 利用GOmir工具【6】对组织特异性表达的miRNA的靶基因做Gene 聚类分析，发现不同组织表达的miIⅢA在参与生物学过程，行使分子功能和细 胞组分构成方面都存在一定程度的差异。提示miRNA的组织特异性也伴随着功 能的差别。 基因，并可以间接影响线粒体合成相关基因。 关键词：miRNA，基因本体，生物信息学 4 AbstraCt aclassof～22nt small MicroRNAs(miRNAs)are RNAsthat endogenous guide post·traIlscriptional base with genesilencingby pairingtargetmRNAs【l】．miIⅢAs rolesin as playimportantmanysignaling pathways，such andcell atsametime proliferation death【2】and present tissue．specincexpression innomal pattems humantissuesandcaIlcer ceIrtainmiRNAis cells【3-4】．A reguIated f．actors tothe ofits bytranscription bindingpromoterpri—miRNA，and maytargets andtheir manygenes．miRNAs asweUas form upstre锄regulators a targetgenes network． complexregulatory theGene Byusing