林谦 第6章 DNA重组.ppt

（LTR） （LTR） Ty因子与反转录病毒非常相似 (1) 二者之间的分子结构非常相似，如均有长末端重复序列LTR；它们转录和翻译的方式也很类似。 (2) 转座是由Ty因子内的基因控制的，且要经过一个RNA阶段。 (3) 虽然Ty因子不产生感染颗粒，但在经诱导发生转座的细胞中存在着Ty病毒样颗粒(VLPs,Virus-like particles)。 (4) 仅有某些Ty因子在任何酵母基因组中都有活性，大部分没有转座能力，此和惰性的内源性前病毒相似。 (5) 反转录病毒首先被观察到的是以传染性病毒颗粒的形式存在，并能在细胞间传播；而反转座子是被当作基因组中的一部分而被发现的，它们可以在基因组内进行转座，但不能在细胞间迁移。 图6-25 类似于病毒的Ty元件颗粒 6.3.2.3.2 果蝇的copia元件 Copia元件长度约为5.1 kb，每个果蝇基因组大概有20~60个拷贝，其LTR长度约为276 bp。每一个copia内部含有单一的长阅读框架，编码由整合酶、逆转录酶和一种DNA结合蛋白组成的多聚蛋白质。在果蝇细胞中也含有没有传染性的类似于病毒的颗粒。 6.3.2.3.3 LINE和SINE 在哺乳动物中最为丰富的可移动元件是缺乏长末端重复序列(LTR)的逆转录转座子，有时也称为非病毒逆转录转座子。 这种中度重复DNA序列在哺乳动物基因组中分为两类：长散布重复元件(LINEs)和短散布重复元件(SINE)。 虽然这些可移动元件不包含LTR，但现有的证据表明他们的转移要通过一个RNA中间体。 人类DNA中的LINE序列可分为L1和L2两类。它们的转座机制相似，但是序列不同。 在当代人类基因组中只有L1家族成员能够转移。L1-DNA的转录终止并不总是精确的，有时通读，有时提前结束，结果导致一些转录产物过长或过短，这就是L1序列不均一的原因，被截短的L1很可能丧失了某些功能。 LINE序列在人类基因组中约90万个位点上出现，比例接近整个人类DNA的21%。 通常LINE的两侧是短正向重复序列(这是转座子的特征)，并且含有2个开放阅读框(ORFs)。 目标位点正向重复序列在基因组中不同位点的元件拷贝之间长度各异。 ORF1约为1kb长，编码一个RNA结合蛋白质。 ORF2约为4kb长，编码一个带逆转录酶和DNA核酸内切酶活性的双功能蛋白质。 在人类基因组中可移动元件第二丰富的类别是SINE，约占整个人体DNA的13%。 SINE在长度上从100到400 bp不等。这些逆转录转座子不编码蛋白质，但是大部分的包含一个富含A/T序列的3端，这类似于LINE。 SINE是由RNA聚合酶III转录的，相同的核内RNA聚合酶转录基因编码tRNA，5S rRNA，和其他稳定小RNA。 在人类基因组中SINE大约存在160万个位点。 在这些位点中约有110万个是Alu元件，之所以命名为Alu元件是因为它们中的大多数包含一个限制性内切酶AluI的识别位点。 Alu元件表现出与7SLRNA相当的序列同源性。也许Alu元件是由7SLRNA进化而来的。7SL是一种信号识别粒子的成分。 Alu序列与人类遗传病神经纤维瘤有关。在病人体内，Alu序列插入到一种抑瘤基因——NF1的内部，导致该基因的失活，从而丧失抑制癌细胞生成的功能。 串联重复基因 重复DNA 加工假基因 间隔DNA 6.3.3 转座的分子机制 转座机制一般分为两种类型： 简单转座、直接转座、保留型转座、非复制型转座：先将原来的转座元件剪切，再插入到新的位置； 复制型转座：将原来的转座元件复制一份，再插入到新的位置。 杂种表型正常但不育 图6-14 转座子对基因X的可能影响 6.3.1 原核生物的转座子 首先发现的转座子是插入序列(IS)，因其插入使靶点处基因失活而被发现。IS能从DNA的一个位点插入到另一个位点，导致靶位点基因以及和靶位点基因在同一个操纵子内，但位于靶位点基因下游的基因表达受阻，此现象称为极性效应。 6.3.1.1 第一类转座子IS IS是最简单的转座因子。IS元件是细菌