《富士苹果MdAPETALA2基因的克隆与表达分析》.pdfVIP

西北植物学报 ，2012，32(7)：1309—1315 ActaBOt．Borea1．-Occident．Sin． 文 章编 号：1000—4025(2012)07—1309—07 富士苹果 APE LA2基 因的克隆与表达分析 张计育，宣继萍，贾晓东，刘永芝，王 翔，郭忠仁 (江苏省中国科学院植物研究所 ，南京 21O014) 摘 要：基于苹果基因组测序序列，从 长‘富6号’富士苹果中分离了 APE LA2基因序列，通过生物信息学方 法分析结构特征，利用实时荧光定量 RT-PCR技术研究其在不 同器官 中的表达特性 。结果表 明：(1)MdAPETA— LA2基因cDNA序列为 1614bp，该基因最大开放阅读框为 1389bp，编码 462个氨基酸，含有 2个保守的AP2结 构域和核定位信号；其编码区含有 8个 内含子和 9个外显子 ；启动子区域含有许多光响应元件 ，如 ATCT—motif、G- Box、GA—motif、I-box、Spl、TCCC—motif等 ，以及水杨酸响应元件 、赤霉素响应元件 、防御和逆境响应元件等。(2) M APE LA2基 因在苹果各种器官中均有表达 ，但不 同组织 中表达量存在差异，在种子 中的表达量最高，其次是 根和花 ，在叶和茎 中的表达量最低 ；在花药 中的表达量最大，其次是花托和子房 ，在花瓣、花梗和花柱 中的表达量相 对较少 。(3)苹果 M APETALA2基因属于 AP2亚族 ，可能在种子的发育过程 中起着非常重要 的作用。 关键词 ：富士苹果；MdAPETALA2；基 因克隆；启动子 ；表达模式 中图分类号 ：Q789 文献标志码 ：A IsolationandExpressionAnalysisofMdAPETALA2Genefrom FujiApple ZHANGJi—yu，XUAN Ji—ping，JIA Xiao—dong，LIU Yong—zhi，WANG Xiang，GUO Zhong—ren (InstituteofBotany，JiangsuProvinceandtheChineseAcademyofSciences，Naniing210014，China) Abstract：Basedontheapplecompletegenomiesequences，thefulllengthcDNA，genomicDNA andpromot— ersequencesofMdAPETALA2wereisolatedfrom theFujiapple．Oenestructurecharacterizationswere analyzedusingthebioinformaticssoftware．Real—timequantitativePCR (qRT—PCR)wasperformedtode— terminetheexpressionpatternofM dAPETALA2indifferenttissuesofapple．1614bpcDNA sequenceof M dAPETALA2wascloned．Bioinformaticsanalysisshowedthattheopenreading frameofthisgenewas 1369bp，encoding462amino acids，containing tWO conservativeAP2 structuredomainsandnuclearloca— tion signa1．Thisgenecontains8intronsand9exons．Thepromoterhasmanylightresponsiveelements， suchasATCT—motif，G—Box，GA—motif，I—box，Spl，TCCC—motif，andSOon．Moreover，salicylicacidrespon— siveness，defenseand stressresponsiveness，and drought—inducibilitywerefound in promoterofM dAP— ETALA2．Expression analysis showed thattheexpression ofM dAPETALA2 genewasdetecte