《楠木种属及其近缘属叶绿体 matK 基因序列的鉴定》.pdfVIP

贵州农业科学 2014，42(2)：27～31 GuizhouAgriculturalSciences [文章编号]i001—3601(2014)02—0066—0027—05 楠木种属及其近缘属叶绿体matK基因序列的鉴定 陈云霞，南程慧，薛晓明 (南京森林警察学院，江苏 南京 210023) [摘 要]为给楠木及其近缘属植物的DNA分子鉴定提供依据 ，对 30种楠木及其近缘属植物进行基因 组 DNA提取 ，叶绿体 matK序列扩增与测定，并进行序列比对与人工校正，计算属 间及种间的遗传距离，比 较序列间的差异，构建系统发育树。结果表明：matK各基因序列的组成中G+c含量平均为36．6 。3O个 楠木及近缘属植物共发现 72个碱基变异位点，碱基变异率为 9．38 。其 matK基 因序列种间遗传距离为 0～ 0．098，平均遗传距离为0．010。聚类分析 ，新樟属为 1个分支，楠属和润楠属聚为 1个分支，其余樟属 、 木姜子属、新木姜子属、山胡椒属、檫木属 、月桂属与黄 肉楠属聚为 1个分支。故 matK序列基本可以对楠木 及其近缘属植物进行属间鉴定 ，但在种 间水平上并不可行 。 [关键词]楠木；近缘属；鉴定；matK [中图分类号]$792．24 [文献标识码]A IdentificationofChloroplastmatK SequenceofPhoebe andItsRelatedGenera CHEN Yunxia，NAN Chenghui，XUE Xiaoming (NanjingForestPoliceCollege，Nanjing，Jiangsu210023，China) Abstract：ToprovidereferencesforDNA identificationofPhoebeanditsrelatedgenera，genomicDNA wasextractedfrom 30accessions，thechloroplastmatK sequenceswereanalyzed，theinter—specificgenetic distanceswerecalculated。andthephylogenetictreesofalltheaccessionstestedwereconstructedbasedon theobtaineddistancedata．TheresultsindicatedthattheaverageG+CcontentinvariousmatK sequences was36．6 ．72basevariationpointswerefound，accountingfor9．38 ．Theinterspecificgeneticdistance rangedfrom 0to0．098，withanaverageof0．01O．Theclusteranalysisshowedthatthegeneratestedwere clusteredintothreebranches，onewasNeocinnamomum delavayi，onewasPhoebeandMachilus，and othersbelongedtoanotherone，includingCinnamomum，Litsea，Neolitsea，Lindera，Sassafras，LGURUS andActinodaphne．matK couldbeusedtoidentifyPhoebeanditsrelatedgenera，butcouldntbeusedat thespeciesleve1． Keywords：Phoebe；relatedgenera；identification；matK 楠木，素有木 中贵族之称 ，是我 国珍贵用材树 种鉴定 的 DNA条形码序列主要集 中于叶绿体 种，有些种已临近濒危状态。为了更有力地保护我 DNA(chloroplastDNA，cpDNA)和核糖体 DNA转 国珍贵林木资源 ，对楠木物种 的准确鉴定迫在眉