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siRNA转运的初步应用
硕士研究生:谭燕
指导教师:张兴梅副教授
摘 要
恶性多形性胶质瘤(glioblastoma
瘤,预后非常差:成年病人1、3或者5年的生存期的概率大约分别为30%、5%、
3%。在20%~30%的GBM病人中存在人表皮生长因子受体(epidermalgrowth
factor
研究证明其表达变化与GBM的恶化及放、化疗抗性有密切关系;在其它恶性肿
瘤如非小细胞肺癌、大肠癌、结肠癌等中均存在不同程度的EGFR及EGFRvIII
的高表达。因此EGFR及其突变体可以作为肿瘤治疗的主要靶标。目前,EGFR
单克隆抗体已经应用于临床治疗,这种抑制剂阻断EGFR受体,使得EGFR的
酪氨酸激酶信号通路失活,从而抑制肿瘤细胞的增殖和迁移。由于抗体药物本
身的免疫原性,且EGFR在正常组织中也表达,EGFR单克隆抗体的应用出现
了许多不良反应、长期使用易出现耐药性,因此开发靶向性强、免疫原性小、
分子量小、毒性小、稳定好的制剂更为重要。另有研究表明EGFRvlII仅在肿瘤
组织中表达,可作为高特异性的治疗靶标;而核酸适配子技术的发展为新的抗
肿瘤药物的研发提供了可能。
适配子(aptamer)是能形成特定的三维空间结构的寡核苷酸,以高亲和力
和高特异性与靶分子结合。与传统的抗体相比,适配子有如下特征:分子量小,
可在体外快速合成,易于化学修饰;稳定性好便于长期储存;毒性低,免疫原
性小;有较快较好的组织渗透性。这些优点使得适配子可用于疾病的诊断和治
摘要
evolutionof
疗。适配子可通过指数富集配基的系统进化技术(systematicligands
byexponential
选得到。
近几年有研究报道筛选出更复杂靶分子的适配子,如细胞膜蛋白、全细胞
定靶分子蛋白,且靶分子或者靶蛋白能在活性状态下维持细胞表面正常的空间
结构和糖基化位点,这样易于筛选出肿瘤细胞表面的新的靶分子或靶蛋白,对
肿瘤标记物的发现有重要意义。
文库中筛选出与U87.EGFRvlII细胞高亲和力、高特异性结合的适配子。利用经
典ELISA的方法和生物素.链亲和素系统,建立并进行细胞酶联反应(cell
enzyme.1inked
力;利用共聚焦显微镜检测技术寻找能被U87.EGFRvIII细胞表面受体介导内吞
的适配子,并用此适配子作为一种传递c.MetsiRNA进入细胞介导基因沉默的工
具。
成两端为固定序列、中间为30个nt的随机序列、全长为76个nt的ssDNA文
库。以贴壁培养过夜的U87.EGFRvlII细胞为靶标,经过孵育、洗涤、分离后,
通过不对称PCR法分离单链ssDNA,大量扩增得到下轮筛选的亚库。筛选过程
中不断增加筛选的强度(如增加鲑精DNA量、缩短孵育时间、增加洗涤强度等)。
从第四轮筛选开始,每轮引入EGFRvlII蛋白表达阴性的U87细胞作为反筛细胞,
以去除细胞表面相同受体或者结构的干扰,经过14轮cell.SELEX筛选和鉴定,
得到与U87.EGFRvlII细胞高亲和力、高特异性结合的适配子。
用生物素标记的上游引物对所筛选的亚文库进行不对称PCR扩增,得到生
II
硕士学位论文
U87细胞的结合力,在细胞数目和投入的ssDNA的量相同的条件下测定吸收度,
从而判断出筛选过程中结合到U87.EGFRvlII细胞上的ssDNA的富集情况。
将第14轮的筛选产物进行扩增、纯化、T载体克隆、“蓝.白”斑筛选并测序,
STRUCTURE
得到相应适配子的序列,并用RNA 5.2软件预测DNA的二级结构,
并将这些结构进行分类,根据序列的相似性挑选出进行后续功能研究的适配子。
为了鉴定适配子的特异性和亲和力,用FITC标记适配子,然后与
U87.EGFRvlII细胞孵育结合,于荧光显微镜下观察结合情况;用流式细胞技术
回归分析获得适配子的解离常数。
共聚焦显微镜定位观察适配子与U87.EGFRvlII细胞的结合位点,寻找能被
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