《人锰超氧化物歧化酶基因剪接异构体的表达分析》.pdf

生物技术通报 · 研 究 报 告 · BIOTECHNOL0GY BULLETlN 2010年 第 3期 人锰超氧化物歧化酶基因剪接异构体的表达分析 王峰 ’ 黄璐 圆。 (暨南大学药学 院，广州510632；2暨南大学中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室 ，广州510632； 、 中国科学院广州生物医药与健康研究院分子医学 中心 ，广州 510633) 摘 要 ： 对人锰超氧化物歧化酶 (humanmanganesesuperoxidedismutase，hMn—SOD)基 因剪接异构体进行分析 ，并检测异 构体的表达情况。在 GenBank库 中检索人锰超氧化物歧化酶基 因异构体及编码基 因组序列 ，利用VectorNTI9生物软件进行 核酸及蛋 白序列 比对 ；利用RT—PCR方法分析锰超氧化物歧化酶基 因异构体 的表达。结果显示，在 GenBank库检索发现有 3 种人锰超氧化物歧化酶基 因异构体 ，剪接 异构的类型为可 变的5剪接位点和外显子盒 ，各异构体基 因 内含子均符合 “GT．AG” 规则。3种基因异构体 编码 两种异构体蛋 白，即222个氨基酸的人锰超 氧化物歧化 酶蛋 白以及 中部缺 少 39个氨基酸 的截短 型异构蛋 白。RT—PCR检测结果表明，剪接异构体 hMn—SODb在 HEK293T和 HSC细胞 中的表达 比在 HepG2细胞 中高，未见 异 构体 hMn—SODc的表达。 关键词 ： 锰超氧化物歧化酶 剪接异构 表达 StudyonExpression ofHumanM anganeseSuperoxide DismutaseGeneSplicingIsoforms WangFeng ‘ HuangLuyuan (CollgeofPharmacy，JinanUniversity，Guangzhou510632； GuangdongProvinceKeyLaborat。ryofPharmacodynamic ConstituentsofTCMandNewDrugsResearch，Guangzhou510632； CenterofMolecularMedicine，GuangzhouInstituteof BiomedicineandHealth，ChineseAcademyofSciences，Guangzhou510633) Abstract： Itwastoanalyzethesequenceofhumanmanganesesuperoxidedismutasegene(hMn—SOD)splicingisoforms，andto detecttheexpression ofhMn—SOD splicing isoforms．The sequenceofhMn—SOD transcriptsplicing isoformsand itsgenomicsequence wereobtainedbysearchingGenBank，andalignmentofhMn—SOD transcriptisoformsnucleotide sequencesand codedaminoacid se· quenceswerecarried outbyVectorNTI9 software．RT—PCR wasemployed toanalyzeexpression ofthehMn—SOD transcriptiso— forms．ResultsindicatethattherearethreehMn—SOD splicingisoformsinGenbank．Thetypesofalternativesplicingarealternative5 splicingsitesandcassetteexons．Allsequencesattheexon—intronjunctionsinallisofomrsofhMn