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《人锰超氧化物歧化酶基因剪接异构体的表达分析》.pdf
生物技术通报
· 研 究 报 告 · BIOTECHNOL0GY BULLETlN 2010年 第 3期
人锰超氧化物歧化酶基因剪接异构体的表达分析
王峰 ’ 黄璐 圆。
(暨南大学药学 院,广州510632;2暨南大学中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室 ,广州510632;
、 中国科学院广州生物医药与健康研究院分子医学 中心 ,广州 510633)
摘 要 : 对人锰超氧化物歧化酶 (humanmanganesesuperoxidedismutase,hMn—SOD)基 因剪接异构体进行分析 ,并检测异
构体的表达情况。在 GenBank库 中检索人锰超氧化物歧化酶基 因异构体及编码基 因组序列 ,利用VectorNTI9生物软件进行
核酸及蛋 白序列 比对 ;利用RT—PCR方法分析锰超氧化物歧化酶基 因异构体 的表达。结果显示,在 GenBank库检索发现有 3
种人锰超氧化物歧化酶基 因异构体 ,剪接 异构的类型为可 变的5剪接位点和外显子盒 ,各异构体基 因 内含子均符合 “GT.AG”
规则。3种基因异构体 编码 两种异构体蛋 白,即222个氨基酸的人锰超 氧化物歧化 酶蛋 白以及 中部缺 少 39个氨基酸 的截短
型异构蛋 白。RT—PCR检测结果表明,剪接异构体 hMn—SODb在 HEK293T和 HSC细胞 中的表达 比在 HepG2细胞 中高,未见
异 构体 hMn—SODc的表达。
关键词 : 锰超氧化物歧化酶 剪接异构 表达
StudyonExpression ofHumanM anganeseSuperoxide
DismutaseGeneSplicingIsoforms
WangFeng ‘ HuangLuyuan
(CollgeofPharmacy,JinanUniversity,Guangzhou510632; GuangdongProvinceKeyLaborat。ryofPharmacodynamic
ConstituentsofTCMandNewDrugsResearch,Guangzhou510632; CenterofMolecularMedicine,GuangzhouInstituteof
BiomedicineandHealth,ChineseAcademyofSciences,Guangzhou510633)
Abstract: Itwastoanalyzethesequenceofhumanmanganesesuperoxidedismutasegene(hMn—SOD)splicingisoforms,andto
detecttheexpression ofhMn—SOD splicing isoforms.The sequenceofhMn—SOD transcriptsplicing isoformsand itsgenomicsequence
wereobtainedbysearchingGenBank,andalignmentofhMn—SOD transcriptisoformsnucleotide sequencesand codedaminoacid se·
quenceswerecarried outbyVectorNTI9 software.RT—PCR wasemployed toanalyzeexpression ofthehMn—SOD transcriptiso—
forms.ResultsindicatethattherearethreehMn—SOD splicingisoformsinGenbank.Thetypesofalternativesplicingarealternative5
splicingsitesandcassetteexons.Allsequencesattheexon—intronjunctionsinallisofomrsofhMn
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