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木薯块根基因表达谱分析 摘要 木薯是世界六亿人赖于生存的主要食物来源，木薯制取燃料乙醇，既 有广阔的市场前景，又是解决我国能源安全的一条重要途径。 本文利用华南124木薯，块根膨大期的块根总RNA构建了cDNA文库， 木薯块根基因表达的情况。文库中得到了2878条序列，对2878个基因进 行基本的分析、序列的比对、功能注释、分析了表达基因的丰度、基因注 释的情况、基因功能分类的情形；并进行了木薯苗期、块根形成期、块根 膨大期、工艺成熟期四个生育时期共12个组织探针的杂交，得到木薯四个 生育时期基因表达的情况。使用生物信息学软件，分析了基因的差异表达 的变化；使用T检验、K--mean聚类来分析块根表达谱，分析了不同时期 块根中特异差异表达的基因，差异表达的基因以及块根膨大期的根、茎、 叶、块根组织的特异差异表达基因的情况。分析表达说明，在块根中差异 上调的基因多于差异下调的基因。在块根膨大期中，根、茎、叶三个组织 的特异差异基因呈现规律的变化，根的特异差异上调的基因最多，叶的特 异差异上调基因最少，茎的特异差异上调与下调的基因数相差不大。反之， 在根中特异差异下调的基因最少，叶中特异差异下调基因最多。块根的基 因表达和木薯块根的形成、膨大、成熟等生理过程吻合，同时，也展示了 木薯块根的生长发育中复杂的生理生化活动的遗传基础。 构建了木薯块根的单一cDNA文库，揭 本研究获得了1708条新的基因， 示了木薯生理生化变化的遗传基础， 为重要基因的功能验证打下基础；为 转基因木薯的研究打下基础；同时，也是国内首次在木薯的研究上使用生 V使用过一次cDNA，傲阵列检 物芯片技术，国外的报道中，只有LopezC,Jorge 测细菌性枯萎病菌侵染下木薯的基因表达变化。使用在木薯生理上的研究 7 尚属首次。本研究也为研究木薯病虫害机理打下基因分析的基础。 关键词：木薯块根基因表达谱表达序列标签cDNA微阵列 Ⅱ PROFILEoFCASSAVATUBER GENEEXPRESSION ABSTRACT Cassavaisa shrub tothe perennialbelonging ofalimentationforalmost forits constitutesthesource primadlystarehyroots．It canbe from is 600million overtheworld．Ethanol Cassava，it people gained our of sources． resourcethatresolves energy great problem tuber innaturalsoil．Cultivar cassava SC-124， Seven．month．old W3$grown intheeDNA and also landracefrom