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药用植物内生芽杆菌的多样性和系统发育研究
摘 要
本论文以50株分离自药用植物的内生芽孢杆菌为研究对象,采用数值分类、
16SrDNA
PCR.RFLP、BOX-PCR指纹图谱、16SrDNA序列分析方法对供试菌株
的生物多样性、系统发育进行了系统研究,并测定了供试菌株对几种作物真菌病
原菌的拮抗作用。获得以下主要研究结果:
供试药用植物内生芽孢杆菌具有丰富的表型及遗传多样性。与分类地位已知
rDNA
的典型菌株进行比较,依据表型性状、16S PCR.RFLP及BOX.PCR的聚
类分析,分别将供试菌株分为13、16和27个表观群和遗传群。表观特征表明大
部分菌株具有较高的耐性。在所用的限制性内切酶中,Mspl切割的带谱最丰富,
是反映内生芽孢杆菌16SrDNA序列差异性的最有效的限制性内切酶。
BOX-PCR指纹图谱揭示的遗传多样性更丰富,能区分种内菌株间的遗传差异性。
在数值分类84%相似性水平上位于同一表观群的供试未知菌株大多分布于几个
综合的BOX.PCR群内。总的来说,本研究所采用的表型分群和遗传型分群的结
果在总体趋势上是一致的。
rDNA全序列,并构
依据多样性分析结果,选择代表菌株测定保守基因16S
建系统发育树。结果表明:供试的代表菌株SCAUll与球形芽孢杆菌(Bacillus
subtilis)
的两个亚种,代表菌株SCAU39与巨大芽孢杆菌(Bacillus
megaterium)的亲缘
rDNA基因全序列分析结果揭示了供试内生芽孢杆菌的系统发育
关系最近。16S
关系。 .
对玉米弯孢菌(CurvulariaLunata),小麦禾谷镰刀菌(Fusarium
graminearum),
串珠镰刀菌(Fusarium Turcica)和油
moniliforme),玉米大斑病菌(Setosphaeria
菜菌核病菌(Sclerotiniasclerotiorum)有较强的拮抗作用。该结果为芽孢杆菌在
生物防治方面的应用奠定了基础。
关键词:药用植物;内生芽孢杆菌;遗传多样性;系统发育;拮抗
Abstract
strainsisolated medicinal were
bacillus from
Fiftyendophytic plants
characterizednumerical rDNA
PCR—RFLP,BOX-PCR
by taxonomy,16S fingerprints
and rDNA todescribethe and
16S biological
sequence diversityphylogeny.The
oftheisolates from weretestedatsame
antagonism againstpathogenicfungi crops
wereas
time.Themainresults follows:
A and
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