家蚕多种分子标连锁图谱的构建及分析.pdfVIP

家蚕多种分子标记连锁图谱的构建及分析 撼要 家蚕多种分子标记连锁图谱的构建及分析 中文摘要 高密度分子连锁图谱的构建可为家蚕分子辅助育种提供理论基础。家蚕是一种 雌完全连锁的物种，通用的连锁图构建软件M印臻abf没有考虑染色体不发生交换 的物种。吴青祥等针对此发表了“：{#交叉配子形成体的连锁图谱构建方法”，并针对 家蚕开发了F2lnkSilk作图软件，但至今尚无利用此软件构建家蚕连锁图谱的报道。 另外，圈前利用同～个作图群体构建多种分子标记连锁图的研究还比较少，给家蚕 分子图谱的整合工作带来很大的困难。本文就上述问题进行了相关探讨： l、以已代91个个体为分离群体翡300个AFLP标记和69个F2代个体约分离群 比有所增加，总图距显著增加，平均图距也有较大的增加，但产生的二联体数基本 相同；就单个连锁群而言，使用F2ln砖Silk软件分析得到的总图距和平均图距也相 应增大，且有很多两个标记问的图距大予50cM的情况，反映了该方法的部分不完善 性。 2、构建了一个以大造、C108为亲本，以其F2代92个个体为研究对象的作图群 体，设计RAPD引物和SSR引物，构建了家蚕RAPD．SSR分子标记综合图谱，得到如 下结果： ／雩|物。经#检测后，有303个位点符合3：l的分离比，占总数昭78。5％，其中大造 137个，C108 166个。98对SSR引物，有62对引物出现多态性位点，占总引物数的 63．3％。经矛检测后，有56对引物的扩增结果符台l：2：l的分离比，占总数的90．3％． Mapmaker软件进行了图谱构建，其中连锁的143个标记构成了33个群，占有效位 点的39．8％，，占总多态性的31．9％。 (3)33个连锁群中，最大的连锁群为第2连锁群，共24个标记，最小的连镂 群只有两个标记。最长的连锁群为705。7cM，最短的连锁群为1．1cM，位点阅的最 大图距为89．1 cM。 cM(大子50cM的只有此一个)，最小图距为1．1 家蚕多种分子标记连锁图谱的构建及分析 摘要 (4)33个连锁群覆盖基因组的总长度为2940．9cM，每条连锁群的平均长度为 89．1 cM，家蚕有28个染色体，本文所构建的连锁群总数为33个，说明这些连锁群 中有些是相互连锁的。 对染色体对应的SSR图谱进行了比较，本文得到的33个连锁群中包含RAPD标记 定位到相应的染色体上，另外5个SSR群与RAPD标记不连锁。 随着该分子连锁图谱标记密度的增加和标记种类的增加，可望用于家蚕经济性 状的QTL研究和家蚕分子图谱的整合，为家蚕分子标记育种技术的建立和应用提 供重要的参考依据。 关键词： 家蚕； 微卫星标记(ssR)；随机扩增多态性(RAPD)；连锁图谱 作者： 段雪梅 指导老师：司马杨虎教授 徐世清教授 II 骞蚕多种分子标记连域图谱的构建及分析 摘要 Constructionand ofaMuIti—mark譬r Analysis Linkage M菇p硒rSil脚orm，勋磁蜒蹴秽珐 A辩STRAC，I． Constructionof de啦semolecuIar can basisfor