短枝型苹果SSH文库构建及相关基因表达分析.pdfVIP

短枝型苹果SSH文库构建及相关基因表达分析.pdf

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中国农业科学 2013,46(20):4301-4309 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.20.013 短枝型苹果SSH 文库构建及相关基因表达分析 1, 2 1 1 1 宋 杨 ,吴树敬 ,张艳敏 ,陈学森 1 2 (山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安271018 ; 中国农业科学院果树研究所,辽宁兴城125100) 摘要:【目的】寻找苹果短枝型枝条形成相关基因,为进一步探索苹果短枝型芽变形成机理及选育新的短枝 型苹果品种奠定基础。【方法】利用抑制性差减杂交技术构建正反向苹果短枝型芽变枝条和正常型枝条差异表达 cDNA 文库,利用荧光定量RT-PCR 验证文库中克隆的插入片段。【结果】从两个文库中共获得291 个有效阳性克隆, 插入片段大小主要分布在300—600 bp 之间。利用GenBank 的BLAST 比对分析,其中126 个表达序列标签(EST) 找到了与之匹配的同源序列。获得的cDNA 片段功能涉及代谢、转录、胁迫响应、转运、光合和信号转导;有165 个EST 片段未找到同源序列。对文库中EST 序列进行实时荧光定量RT-PCR 验证,结果显示这些EST 序列在短枝型 芽变枝条与正常型枝条之间差异性表达。【结论】通过构建短枝型苹果正反向文库,得到一些与短枝型苹果枝条节 间长度相关联的基因,这些基因可能对短枝型苹果枝条的伸长具有一定作用。 关键词:苹果;短枝型;SSH;表达序列标签;实时荧光定量PCR Construction of the Suppression Subtractive Hybridization Library and Analysis of Related Genes of Spur-Type Apple (Malus domestica Borkh.) 1, 2 1 1 1 SONG Yang , WU Shu-jing , ZHANG Yan-min , CHEN Xue-sen 1 ( College of Horticulture Science and Engineering, Shandong Agricultural University/State Key Laboratory of Crop Biology, Tai ’an 2 271018, Shandong; Institute of Pomology, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Xingcheng 125100, Liaoning ) Abstract: 【Objective 】The aim of this experiment is to explore genes related to spur type shoots of apple and to try to understand the mechanism of sport for breeding new spur type variety. 【Method 】A forward and reverse suppression subtractive hybridization library were constr

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