柑橘类病毒的分子鉴定与分型.pdfVIP

中国农业科学 2008,41(9):2670-2677 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.09.014 柑橘类病毒的分子鉴定与分型 1 1 1,2 2 3 3 马先锋 ，韩 健 ，邓子牛 ，舒广平 ，Rizza S ，Catara A 1 2 3 （湖南农业大学园艺园林学院，长沙 410128 ，中国； 国家柑橘改良中心长沙分中心，长沙 410128 ，中国；Department of Phytosanitary Sciences and Technologies, University of Catania, Italy ） 摘要：【目的】检测湖南地区柑橘所携带的柑橘类病毒类型，并鉴定柑橘类病毒的亚型。【方法】以田间柑橘 枝条韧皮部为试材，提取总 RNA，反转录成 cDNA，再用不同类型类病毒的特异引物进行 PCR 扩增，鉴定出各个样 品所携带的柑橘类病毒类型；通过测序分析各类型的序列，并与国内外报道的序列进行同源性分析，确定所测样 品的亚型。【结果】建立了CEVd、CVdII、CVdⅢ等柑橘类病毒的RT-PCR检测方法。在5 个供试样品中检测出3种 类型的柑橘类病毒，即柑橘裂皮病类病毒（citrus exocortis viroid，CEVd）、柑橘类病毒Ⅱ型（citrus viriod Ⅱ，CVdⅡ，又名 hop stunt viroid，HSVd）和柑橘类病毒Ⅲ型（citrus viriodⅢ，CVdⅢ），其中 CVdⅡ和 CVd Ⅲ为国内首次发现。亚型分析表明 CVdⅡ可能为新的亚型；CVdⅢ为 b 亚型，可能具有矮化功能。【结论】在中国 鉴定出 3 种类型的柑橘类病毒，CEVd 与国内已报道的序列完全一致，其中 CVdⅡ和 CVdⅢ为首次在中国发现；检 测到的CVdⅡ可能为新的亚型。 关键词：柑橘；类病毒；检测；序列分析；分型 Molecular Detection and Characterization of Citrus Viroids 1 1 1,2 2 3 3 MA Xian-feng , HAN Jian , DENG Zi-niu , SHU Guang-ping , Rizza S , Catara A 1 2 ( Horticulture and Landscape College, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China; National Center of Citrus Improvement Changsha Subcenter, Changsha 410128, China ; 3Department of Phytosanitary Sciences and Technologies, University of Catania, Italy) Abstract: 【Ob