鸭瘟病毒ul1基因分子特性及转录时相分析.pdfVIP

J’嬲㈣ 本论文的创新性工作 1．应用生物信息学相关软件对鸭瘟病毒(Duckplague O ULIO基因全长1230 基因(GenBank登录号EUl95100)进行了分子特性分析。DPV aa，含有1个信号肽切割位点和8个跨膜区，在24种疱疹病毒参考株 bp，编码409 DPV应该为0【疱疹病毒亚科。 2．数据显示DPVULl0同义密码子的使用呈偏爱性。DPVULl0基因与大肠杆 菌、酵母及人密码子使用频率差值分别有27个，酵母有21个，人有29个。相关性 分析显示DPV ULIO基因密码子与酵母之间存在较显著关系(PO．05)。 3．利用RT-PCR对DPV ULl0基因进行转录时相分析，在感染鸭瘟病毒后O．5h 最早检测到DPV 1 鸭瘟病毒UL0基因分子特性及转录时相分析 研究生： 周涛 指导教师：程安春教授 1上 汪的-rd：l书教授I了笥火]又 中文摘要 对DPV RT-PCR对DPVULl0基因进行转录时相分析，结果如下： 1．鸭瘟病毒ULl0基因的分子特性分析DPV 基酸残基组成，等电点为9．05；ULl0蛋白含有1个信号肽和8个跨膜区，主要定位 CHv 于细胞质中。ULl0蛋白含有15个潜在的磷酸化位点。序列对比分析表明DPV ULl0与与a疱疹病毒的核苷酸同源性较高，其核苷酸序列与Gallid2、 herpesvirus 1、Human l的同源性为 Psittacidherpesvirusherpesvirus5和Meleagridherpesvirus 54．5％，3．5％，41．5％和46．4％，表明它们可能功能相似。 2．鸭瘟病毒ULl0基因序列的密码子偏爱性分析DPVCHv株ULl0基因在其它 相关23株疱疹病毒之间高度保守，与Q疱疹病毒的核苷酸同源性较高。相关数据显 示DPV ULl0同义密码子的使用呈偏爱性。DPVULl0基因与大肠杆菌、酵母及人密 ULl0 码子使用频率差值分别有27个，酵母有21个，人有29个。相关性分析显示DPV 基因密码子与酵母之间存在较显著关系(P0．05)。 3．鸭瘟病毒ULl0基因的转录时相：根据DPV ULl0基因和内参基因13-actin的保 守序列分别设计了荧光定量引物，收集感染鸭瘟病毒后O．5h、1h、2h、4h、8h、12h、 ULl0 行逆转录，以cDNA为模板进行RT-PCR扩增。表明在O．5h最早检测到DPV 基因的转录产物，36h迅速放大，60h达到峰值，72h相对下降。 关键词鸭瘟病毒，ULl0基因，特性分析，转录时相 andtime characterizationcourse Themolecular