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- 2016-03-17 发布于安徽
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DNA指纹在水稻品种鉴定中的应用与展望.pdf
— 4— 江苏农业科学 2014年第42卷第12期
左示敏,周娜娜,陈宗祥,等.DNA指纹在水稻品种鉴定中的应用与展望[J].江苏农业科学,2014,42(12):4-8.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2014.12.002
DNA指纹在水稻品种鉴定中的应用与展望
1 1 1 1 2 2 2 2 1 1
左示敏 ,周娜娜 ,陈宗祥 ,张亚芳 ,汤义华 ,毛从亚 ,许学宏 ,许 明 ,许如根 ,潘学彪
(1.扬州大学农学院/江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/教育部植物功能基因组学重点实验室,江苏扬州225007;
2.江苏省种子管理站,江苏南京210036)
摘要:DNA指纹检测技术应用于植物新品种鉴定已是必然的发展趋势,在水稻上与其相关的技术标准仍待完善。
本文对DNA指纹检测中主要涉及的分子标记及特点进行归纳,并综述了DNA指纹在我国水稻品种鉴定中的应用现
状及存在的问题。提出了构建国家和地方两级DNA指纹标准的必要性和策略,认为可将利用高密度 SNP标记构建
的品种SNP指纹制定为国家标准,而基于核心 SSR标记构建的品种 SSR指纹可制定为地方标准。讨论了两级DNA
指纹标准在品种培育、审定管理、市场监管及品种权保护过程中的应用策略以及仍需研究的问题,以期为建立规范化
的“水稻品种鉴定 DNA指纹”检测方法提供帮助。
关键词:水稻;品种鉴定;DNA指纹;分子标记;标准
中图分类号:S511.037 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2014)12-0004-04
品种是指人类在一定的生态条件和经济条件下,根据人 是由2~4个核苷酸为重复单位(基序,motif)组成的长达几
类的需要所选育的某种作物的一定群体,它具备相对稳定的 十个核苷酸的串联重复序列,如(AT)、(GCA)等,其中n
n n
遗传特性,在生物学、形态学及经济性状上具有相对一致性, 表示重复次数,其在同一物种不同基因型品种间的差异较大,
[5,11]
与同一作物的其他群体在特征、特性上有所区别即特异性,在 并造成SSR长度多态性 。SSR位点两端多是保守的单拷
产量、抗性、品质等方面都能符合相应地区的生产发展需 贝序列,因此,可用两侧的保守序列开发特异PCR引物,并通
[1]
要 。作物优良品种的选育和推广是现代农业建设的重要 过PCR和凝胶电泳技术,显示 SSR位点在品种/个体间的多
支撑,是确保我国粮食安全的关键环节。对植物品种进行 态性。由于生物基因组中存在非常丰富的SSR位点、数量庞
DUS(特异性、一致性和稳定性)测试一直是新品种保护的技 大,理论上分布于整个基因组的不同位置上,因而,基于SSR
[2-3]
术基础和授权的科学依据 。DUS测试主要以田间种植鉴 位点的分子标记可用于鉴别品种的遗传多样性。随着水稻基
定为主,即根据品种间的田间表型差异判定新品种是否有别 因组序列的测序完成,水稻基因组中被发现存在超过 18000
[2-3] [12-13]
于其他品种 。由于DUS测试周期长、易受环境影响、工 个SSR位点,平均每25kb就存在 1个 SSR位点 ,这为
作量大,加上新品种数量越来越多,导致在实践中无法通过 利用S
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