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枣和酸枣基因组大小测定.pdf
第35卷摇 第3期 北 京 林 业 大 学 学 报 Vol.35,No.3 2013年5月 JOURNAL OF BEIJING FORESTRY UNIVERSITY May,2013 枣和酸枣基因组大小测定 吴丽萍摇 唐摇 岩摇 李颖岳摇 尹丹妮摇 庞晓明 北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,计算生物学中心 摘要:本研究旨在找出最适合枣和酸枣的流式细胞术流程,进而测定它们的基因组大小。 结果显示,在所对比的5 种裂解液中,WPB最适合枣属植物细胞裂解。 以毛果杨为内标,通过比较待测样品和内参G0/ G1期峰,计算得出6 种枣属植物基因组大小。 各枣品种的基因组大小有一定差异,平均基因组大小约为418郾56 Mb,其中:‘冬枣爷的基 因组大小为 393郾60依4郾72 Mb,即C鄄值为 0郾40依0郾01 pg;‘鲁枣2号爷的基因组大小为 428郾00 依3郾61 Mb,即C鄄 值为 0郾44依0郾00 pg;‘金丝小枣爷的基因组大小为 424郾00依5郾81 Mb,即C鄄值为 0郾44依0郾01 pg;‘孔府酥脆枣爷 的基因组大小为 429郾60依5郾03 Mb,即C鄄值为 0郾44依0郾01 pg;‘无核小枣爷的基因组大小为 413郾60 依7郾07 Mb, 即C鄄值为 0郾42依0郾01 pg;酸枣的基因组大小为 441郾60 依4郾29 Mb,即C鄄值为 0郾45 依0郾01 pg。 优化的枣属植 物流式细胞术流程,为枣属植物的倍性鉴定奠定了基础。 关键词:流式细胞术;基因组大小;细胞裂解液;毛果杨;枣 鄄鄄 鄄鄄 鄄鄄 中图分类号:S718郾46摇 摇 文献标志码:A摇 摇 文章编号:1000 1522 2013 03 0077 07 WU Li鄄ping;TANG Yan;LI Ying鄄yue;YIN Dan鄄ni;PANGXiao鄄ming. Estimation of genome size of 鄄鄄 Ziziphusjujuba andZ. acdiojujuba. Journal of Beijing Forestry University 2013 35 3 77 83 [Ch, 30 ref.] National Engineering Laboratory forTree Breeding,Key Laboratory of Geneticsand Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, the Center of Computational Biology, College of Biological Sciences and Biotechnology,Beijing Forestry University,100083,P. R. China. The study intendedtofindthe optimalflow cytometry testingprocessforZiziphus plant nuclear DNA content analysis,andto estimatetheir genome sizeaccurately. TheresultsshowedthatWPBwasthebest buffer for Ziziphus plant among the five analyzed buffers. Populus trichocarpa was used as an internal reference and the DNA content was quantified by flow cytometry and calculated as the ratio of mean flurescence of G0/ G1 peak between P. trichocarpa and tested samples. There were minor variation in genome sizes among different Ziziphus plants and the mean genome size was about 418郾56 Mb. The genome size forZ. jujuba cv. Dongzaowas 393郾60依4郾72 Mb,C鄄valueabout 0郾40依0郾01 pg;and 428郾00依3郾61 Mb, 0郾44 依0郾00 pg for Z. jujuba cv. Luzao number 2; 424郾00 依5郾8
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