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2014 年 第 59 卷 第 34 期：3370 ~ 3377 《中国科学》杂志社
论 文 SCIENCE CHINA PRESS
大鼠大脑皮质发育过程中FLnI-L1 表达谱分析
①* ①* ② ②③④† ①⑤†
李运动 , 蔡明登 , 姚茂金 , 袁小兵 , 张晓艳
① 同济大学生命科学与技术学院, 上海 200092;
② 中国科学院上海生命科学院神经科学研究所, 上海 200031;
③ 华东师范大学生命科学学院, 上海脑功能基因组学教育部重点实验室(华东师范大学), 上海 200062;
④ Neurobiology and Anatomy Department, Drexel University College of Medicine, Philadelphia, PA 19129, USA;
⑤ 上海生物信息技术研究中心, 上海 201203
* 同等贡献
† 联系人, E-mail: xiaobing.yuan@; xyzhang@
2014-06-19 收稿, 2014-08-19 接受, 2014-10-29 网络版发表
国家自然科学基金、上海市自然科学基金(12ZR1421500)和上海市卫生和计划生育委员会科研课题资助项目
摘要 基因组中存在大量重复序列, 这些重复序列究竟具有何种生物学功能以及通过何种方式 关键词
发挥功能目前仍然是一个未解之谜. 许多重复序列来源于转座元件在基因组中的整合, long FLnI-L1
转座
interspersed elements (LINE-1, L1)逆转座子是哺乳动物基因组中非常重要的一类转座元件, 由其
高通量测序
来源的DNA 序列占基因组的 17%, 并且L1 可能通过多种方式影响基因组. 虽然目前基因组中
脑皮质
仍然有少数L1 保留转座能力, 大部分L1 由于积累了大量的突变而失去了转座能力. 正常组织
神经发育
中L1 究竟呈现怎样的表达状况, 是否发挥不依赖转座作用的功能, 目前尚缺乏最基本的了解.
通过采用高通量测序方法, 我们在转录组水平研究了大鼠不同发育期大脑皮质中一类不具备转
座活性的全长非完整L1 (FLnI-L1) 的表达模式, 分析了FLnI-L1 的表达与邻近基因的关系. 同时,
通过全基因组水平分析与FLnI-L1 表达趋势一致的基因, 我们推测FLnI-L1 可能参与调控与神
经发育有关的信号通路. 本研究揭示了大鼠大脑皮质发育过程中 FLnI-L1 的表达模式, 为进一
步研究L1 的生物学功能奠定了基础.
哺乳动物基因组中有大量的重复元件, 它们中 的可读框里含有突变[4]. 其中有一类全长 L1, 由于积
的 很 多 来 源 于 转 座 子 的 复 制 [1]. Long interspersed 累了许多突变而丧失了转座活性,
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