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苹果EST-SSRs标记开发及其应用于苹果品种遗传多样性分析.pdf
158
158—165．
多样性分析
李荷蓉1， 王 昆2， 孙欣1， 张眷华3， 房经贵1
艺研究所，江苏南京210014)
sequence
种遗传差异。从NCBI公共数据库中下载63708条苹果表达序列标签(Expressedtag，EST)，首先利用MI—
5．0
sA软件进行SSR位点查找，筛选出符合条件的SSR位点，利用PrimerPlus软件设计49对引物，用非变性聚丙
烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增产物，总结其特点，并回收部分产物测序，以验证其真实性。结
423条含有总计6153个SSR位点。二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是
果显示63708条苹果的EST序列中有5
中扩增出理想的PCR产物，其中25对引物能扩增出多态性条带，测序结果显示引物能扩增出目标片段。ES7一SSR
分子标记体系的聚类结果与富士系苹果家族关系基本吻合。
关键词：苹果；EST；SSR；遗传多样性
中图分类号：Q78 文献标识码：A 文章编号2012)01-0158438
ofEST-derivedSSRmarkersandtheir inapple
Development applications
geneticdiversityanalysis
LI Kun2，SUNXinl，ZHANGChun—hua3，FANGJing—gm‘1
He—ron91，WANG
Institute
210095，China；2．ResearchofPomology，ChineseAcademyofAgricultural
(1．CollegeofHorticulture，NanjingAgriculturalUniversity，Nanjing
210014，China)
Sciences，Xingcheng125100，China；3．InstituteofHorticulture，JiangsuAcademyofAgriculturalSciences，Nanfing
of the
aimedto thedistribution
Abstract：This singlesequencerepeats(SSRs)inexpressedsequence
experimentstudy
newEST-derivedSSR validatethe ofEST-SSRmarkersin
tags(EST)ofapple，develop markers，and application applegenetic
of63708EST of wasobtainedfromtheNationalCentrefor Information
total sequencesapple Biotechnology
diversityanalysis．A
werescreenedfor
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