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DNA芯片(DNA chip) cDNA芯片(cDNA chip) 是指将许多特定的DNA片段或cDNA片段作为探针,有规律地紧密排列固定于单位面积的支持物上 。 一、基因芯片 基因芯片(gene chip) 目 录 由于DNA微阵列技术,基因表达的解析已成为可能,个体基因差异也正在被发现,并产生了一个新的领域—药物基因组学,药物开发的模式发生了根本性的改变。 过去100年以来,人类研制的医药品大约有450种类型(利尿药、受体阻断药、Ca受体阻断药等分别作为一个类型)。而由于基因组科学的诞生,预测今后10年将有4000种的药物类型被开发。这其中有改善以前的药品的缺点(如吸收性、选择性、毒性等)而得到的药物和过去由于各种理由而退出使用的药品的再生。 人类基因组的30亿个碱基对包含的3-4万个基因中,估计有5000个以上的药物标靶,而现在的药物标靶只有不到500个。 标靶:在膜蛋白分子中,像离子通道和G蛋白共轭型受体作为已知药物的标靶已寻找到。如果从新的G蛋白共轭型受体中可以发现其对应配基,那么其中的兴奋剂以及拮抗剂成为新药的可能性极大。 个体基因差异影响药效 即使应用同样的药品,效果显著的患者与无效的患者同时存在,出现副作用与不出现副作用的情况也同样存在,即使被认为效果比较好的降压药也只有60%的有效率。而这里面很大的差别主要是由于基因多态性而引起的,所以对基因多态性进行诊断,从而提高药物应用效率,减少副作用。 确定基因多态性的研究,主要体现在对单核苷酸多态性的检测。基因组解析即可完成这一任务。 是将高度密集排列的蛋白分子作为探针点阵固定在固相支持物上,当与待测蛋白样品反应时,可捕获样品中的靶蛋白,再经检测系统对靶蛋白进行定性和定量分析的一种技术。 二、蛋白质芯片 蛋白质芯片(protein chip) 第 八 节 蛋白质相互作用研究技术 Research Technology of Interaction of Protein 蛋白质之间相互作用以及通过相互作用而形成的蛋白复合物是细胞各种基本功能的主要完成者。几乎所有的重要生命活动,包括DNA的复制与转录、蛋白质的合成与分泌、信号转导和代谢等等,都离不开蛋白质之间的相互作用。 蛋白质之间相互作用研究的重要性 酵母双杂交 各种亲和分析(亲和色谱、免疫共沉淀等) 荧光共振能量转换效应分析 噬菌体显示系统筛选等等 常用蛋白质相互作用的研究技术 一、酵母双杂交技术的基本原理 目 录 ?二、酵母双杂交系统的应用 (一)分析已知蛋白之间的相互作用 (二)对蛋白质功能域的分析 (三)分析未知蛋白相互作用 (四)绘制蛋白质相互作用系统图谱 (五)在药物设计中的应用 人有了知识,就会具备各种分析能力, 明辨是非的能力。 所以我们要勤恳读书,广泛阅读, 古人说“书中自有黄金屋。 ”通过阅读科技书籍,我们能丰富知识, 培养逻辑思维能力; 通过阅读文学作品,我们能提高文学鉴赏水平, 培养文学情趣; 通过阅读报刊,我们能增长见识,扩大自己的知识面。 有许多书籍还能培养我们的道德情操, 给我们巨大的精神力量, 鼓舞我们前进。 * 1958年他因在蛋白质结构方面的工作,主要是胰岛素,第一次获诺贝尔奖。1980年发明了DNA测序方法,第二次获诺贝尔奖。全世界只有四人两次获诺贝尔奖。 Sanger Method Sequencing Gel g b a A deoxyNTP 1 2 3 4 5 g b a A di-deoxyNTP 1 2 3 4 5 目 录 三、DNA自动测序 采用荧光替代放射性核素标记是实现DNA序列分析自动化的基础。用不同荧光分子标记四种双脱氧核苷酸,然后进行Sanger测序反应,反应产物经电泳(平板电泳或毛细管电泳)分离后,通过四种激光激发不同大小DNA片段上的荧光分子使之发射出四种不同波长荧光,检测器采集荧光信号,并依此确定DNA碱基的排列顺序。 SCHEMATIC OF A TRADITIONAL SEQUENCING GEL AUTORADIOGRAM A C G T SEQUENCE IS READ FROM BOTTOM TO GIVE 5’ ACGCTAGGGCTCAA 3’ SCHEMATIC OF HOW A DYE-DEOXY GEL MIGHT LOOK IF PRODUCTS RUN ON DIFFERENT TRACKS A C G T COMBINED REACTIONS COMBINED REACTIONS FLUORESCENCE DETECTOR ACTIVATION LASER DNA自动测序结果举例 目 录 1970年测12000个碱基需一年获更多的时间。1987年测序

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