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生物技术通报
·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期
2013 3
马铃薯 StSnRK2.1 基因克隆与生物信息学分析
刘思妍 毛娟 范阿棋 张俊莲 王蒂 白江平
(甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室 甘肃省干旱生境作物学重点实验室 甘肃农业大学农学院,兰州 730070)
摘 要 : SnRK2 基因对植物的逆境胁迫具有重要的调节作用,以马铃薯 ‘陇薯3 号’( )为试材,采用
Solanum tuberosum
RT-PCR 方法从马铃薯试管苗中克隆得到1 个SnRK2.1 基因cDNA ,命名为StSnRK2.1 ,提交GenBank 注册,注册号为JX280911。
通过生物信息学分析,该基因开放阅读框全长1 008 bp ,编码335 个氨基酸。预测蛋白质分子量约为37.77 kD ,等电点为5.37 ,蛋
白质二级结构预测α-螺旋42.39% ,延伸链 16.42% ,β-折叠7.46% ,无规卷曲33.73% ,具有疏水性,为膜内蛋白。亚细胞定位显示
该基因出现在细胞质及微体中的可能性较大。肽链可能有7 处丝氨酸磷酸化位点,2 处苏氨酸磷酸化位点,以及3 处酪氨酸磷酸化
位点,因此推测该基因在植物抗逆中有重要的作用。
关键词 : 马铃薯 抗旱 基因克隆 生物信息学分析
Cloning and Bioinformation Analysiss of StSnRK2.1 Gene in
Solanum tuberosum
Liu Siyan Mao Juan Fan Aqi Zhang Junlian Wang Di Bai Jiangping
(Gansu Key Laboratory of Crop Imp rovement and Germp lasm Enhancement ,Gansu Provincial Key Laboratory of Aridland Crop Science ,College
of Agronomy ,Gansu Agricultural University ,Lanzhou 730070 )
Abstract: SnRK2s plays an important role in the regulation when plants suffer from adervise environments. The full-length cDNA
sequence of SnRK2.1 in Solanum tuberosum was successfully cloned by RT-PCR with the tube plant. The gene was named StSnRK2. 1 and
has been submitted to Genbank with the accession number JX280911.By bioinformation analysis, the results showed that the StSnRK2.1 has a
complete ORF sequence is 1
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