溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白VscO的基因克隆及生物信息学分析.pdf

生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期 2014 6 溶藻弧菌 Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白 VscO 的基因 克隆及其生物信息学分析 1，2，3 1，2，3 燏1，2，3 1，2，3  庞欢瑛   周泽军   丁   黄郁葱     吴灶和2，3，4  简纪常1，2，3 （1. 广东海洋大学水产学院，湛江 524088 ；2. 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室，湛江 524088 ；3. 广东省教育厅水产 经济动物病害控制重点实验室，湛江 524088 ；4. 仲恺农业工程学院，广州 510225） 摘 要 ： 克隆了溶藻弧菌 （ ）ZJ03 株Ⅲ型分泌系统 （T3SS ）分子伴侣护航蛋白（Chaperone escort protein ） Vibrio alginolyticus 基因，并对其进行生物信息学分析。结果表明， 基因全长462 bp ，编码153 个氨基酸，理论分子量约为18.43 kD ，pI 值为9.22 。 vscO vscO 细胞定位分析显示 基因位于外周质，不存在信号肽，无跨膜区。 基因具有转录起始区-35 区和-10 区，以及翻译识别信 vscO vscO 号SD 序列 （Shine-Dalgarno sequence ）。该氨基酸序列含有多种活性位点，如蛋白激酶C 磷酸化位点等。系统进化树发现溶藻弧菌 的VscO 蛋白与副溶血弧菌聚为同一亚族。VscO 亚基三维结构模型显示其与副溶血弧菌T3SS 的YscO 蛋白有相似构型。信号通路 分析推测VscO 位于T3SS 的针状样结构上。蛋白网络互作图谱发现VscO 与10 种T3SS 蛋白具有相邻关系。本研究结果将为溶藻 弧菌Ⅲ型分泌系统护航机制的研究奠定基础。 关键词 ： 溶藻弧菌 Ⅲ型分泌系统 （T3SS ） 分子伴侣护航 vscO 基因 Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of T3SS Chaperone Escort Protein VscO from Vibrio alginolyticus Pang Huanying1，2，3 Zhou Zejun1，2，3 Ding Yu 1，2，3 Huan Yucong1，2，3 Wu Zaohe2，3，4 Jian Jichang1，2，3 （1. Fisheries College of Guangdong Ocean University ，Zhanj iang 524088 ；2. Guangdong Provincial Ke