基于脂肪酸生物标记及16SrRNA的芽胞杆菌系统发育分析比较.pdfVIP

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2016-05-13 发布于安徽
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基于脂肪酸生物标记及16SrRNA的芽胞杆菌系统发育分析比较.pdf

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生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN ( ) 2015, 31 3 :146-153 基于脂肪酸生物标记与 16S rRNA 的芽胞杆菌系统发育分析比较刘国红刘波林营志唐建阳（福建省农业科学院农业生物资源研究所，福州 350003）摘要：旨在探究脂肪酸作为一种有效的芽胞杆菌分类标记，以25 种芽胞杆菌模式菌株为研究对象，对芽胞杆菌进行脂肪酸组分和16S rRNA 基因系统进化分析比较。结果表明，脂肪酸系统发育分析能充分体现芽胞杆菌种类间的亲缘关系，并且按生物学特性进行聚类分群，而16S rRNA 系统发育仅完美体现出种间的亲缘关系。利用脂肪酸分析可将25 种芽胞杆菌完全准确分开，且将生物学特性相同的芽胞杆菌种类聚为一类，如碱性条件下生长良好的4 种芽胞杆菌（、、 B. agaradhaerens B. alacalphilus B. 和）聚为一类，芽胞杆菌为圆形的芽胞杆菌（、和）聚为一类。结果表明， alkalitelluris B. fastidiosus B. fusiformis B. odysseyi B. sphaericus 脂肪酸分析不仅根据亲缘关系进行聚类，还可以根据生物学特性对芽胞杆菌进行分类。关键词：芽胞杆菌；脂肪酸生物标记；16S rRNA ；系统发育分析 DOI ：10.13560/ki.biotech.bull.1985.2015.04.021 The Comparsion of Bacillus Species Classification Based on Fatty Acid and 16S rRNA Gene Liu Guohong Liu Bo Lin Yingzhi Tang Jianyang - （Agricultural Bio resource Institute ，Fujian Academy of Agricultural Sciences ，Fuzhou 350003 ） Abstract: In order to explore the application of fatty acid composition in taxonomy of Bacillus species, the fatty acid constitutions of 25 strains were detected by Microbial Identification System（MIDI）. The clusters of fatty acid profiles and 16S rRNA gene sequences were analyzed by SPPS16.0 and Mega4, respectively. The results showed that phylogeny analysis based on the fatty acid biomarkers could not only fully re