高通量测序与肿瘤思路课稿.ppt

* 驱动基因指导下的NSCLC临床研究不断深入 Crizotinib 治疗ROS1重排的晚期NSCLC 33例ROS1阳性NSCLC患者入组， 31例接受crizotinib治疗， 在25例疗效可评价患者中: ORR为56%，8周和16周DCR为76%和60%。 中位PFS尚未达到，因为60%的患者仍在随访中，6个月PFS率为71%。 主要毒副作用是视觉障碍、恶心及腹泻。 结论： 虽然该研究仍在继续，但足以说明 crizotinib治疗ROS1阳性NSCLC有效。 Sai-Hong Ignatius Ou,et al. 2013 ASCO Abstract 8032 * 基因多态性对药物作用的影响 药代动力学 药效动力学 药物疗效和毒性的个体差异 基因多态性 药物靶点 药物转运体 药物代谢酶 由于个体差异的存在。。。。 仅有20%~40%的患者从已批准的药物中获益； 70%~80%的药物在临床试验中被淘汰； 许多已被批准药物由于毒副作用而退出市场。 G?T突变 野生型 突变型 基因多态性（SNP）在人群中普遍存在； 人类基因组平均每1200bp就有一个SNP。 不同患者 相同癌症 相同临床分期 相同病理分级 影响因素 相同的药物 相同的计量 患者对药物反应正常 患者对药物不敏感 用药后产生毒副作用 癌症药物治疗个体化 革命性的测序技术发展 Sanger Sequencing 1977 Next-Generation Sequencing 2004 Ion Semiconductor Sequencing 2010 The Chip is the Machine 第一代测序 新一代测序 半导体芯片测序 第一代测序的局限性 操作繁琐，测序时间长 一次只能对单个基因的一个片段进行测序 样本需求量大（微克级） 背景噪音难克服，难以确认低频突变 样本中肿瘤含量要求高 价格昂贵 新一代测序技术（next—generation sequencing） Roche 454， Genome Sequencer FLX ABI (Life) SOLiD 4 System Illumina/Solexa Hiseq 2000 第二代测序技术—高通量 * 高通量测序加速肿瘤个体化用药进程 一次能对多个基因多个片段进行测序 操作自动化，测序时间短 样本需求量小（纳克级） 样本中肿瘤含量需求少 可以确认低频突变(~5%) 价格低廉 * 半导体芯片测序技术的优点 简捷 光学－电子信号 快速 ２个小时完成测序 可扩展性 革命性的突破 样本采集 血/组织/FFPE… 提取DNA /RNA 建 库 模板 制备 测序 /验证 Sh生物信息学分析 医学信息分析 报告 生成 检测流程— 缺一不可/个体化分析 深度分析 初步分析 药物 反应 疾病 风险 肿瘤 突变 三大支撑团队：技术，信息，医学 石蜡包埋组织切片或组织块 新鲜冰冻组织 血液和骨髓 其他 检测流程 肿瘤个体化用药基因检测报告 肿瘤个体化用药基因检测报告 肿瘤个体化用药基因检测报告 CDK VEGF 损伤修复基因 MDM2 反馈调节 p21 切断肿瘤血供 GD-AIF BAI-1 TSP 血管生成因子 抗血管生成因子 p53 Ku70 DNA-PK ATM 逆转放疗抗性 MDR 逆转化疗抗性 细胞周期阻滞 MMP 抑制肿瘤浸润转移 NK 旁杀伤效应 a(II)PH 细胞凋亡 促进作用 抑制作用 Ad-p53多途径抗癌 贝伐单抗在宫颈癌的第一项报告 一项来自Gynecologic Oncology Group协作组的III期随机临床试验，评估贝伐单抗联合 顺铂、紫杉醇、拓扑替康 等药物化疗对复发和转移性宫颈癌的疗效。结果表明：这项试验首次发现靶向药物可以显著改善妇科肿瘤的总体生存状况。贝伐单抗联合 顺铂、紫杉醇、拓扑替康 等药物化疗 可延长患者中位生存期4个月，具有显著的临床获益。 贝伐单抗治疗新诊断胶质母细胞瘤的III期双盲安慰剂对照试验。 结论：新诊断的GBM 使用BEV并没有改善OS，数据显示虽然PFS有所提高，但没有达到显著性标准。考虑到II期临床试验的显著疗效，专家在解读这一结果是认为，应当尝试检验贝伐单抗与其他药物联用的疗效。 通过高通量检测所获得的数据撰写的2篇ASCO投稿均被录用。相应的2篇文章均在cancer research review。另有一篇已被plos one 接收，一篇nature community review。 大连第一附属医院耳鼻喉科作为辽宁省耳聋筛