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北极海洋沉积物中放线菌多样性及抑菌活性筛选.doc
北极海洋沉积物中放线菌多样性及抑菌活性筛选
摘要:采用平板涂布法利用6种培养基从北极海洋沉积物中共分离出109株放线菌。选取34株代表菌株进行16S rDNA测序分析。结果表明,它们分属于链霉菌属(Streptomyces)、假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis),其中Streptomyces为优势菌属;不同采样点获得放线菌的种类和数量有较大不同,站位点P37分离到的放线菌数量和种类最多;在109株放线菌中,有39株对病原菌有抑菌活性,其中有21株、11株和17株放线菌分别对枯草芽孢杆菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌生长有抑制作用。
关键词:北极;海洋沉积物;放线菌;多样性;抑菌活性
中图分类号:Q939.99 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2014)13-3014-05
Diversity and Antibacterial Activity Screening of Actinomycetes in the Marine Sediments of North Pole
CHANG Xian-bo1,LIU Rui-cui1,LIU Wen-zheng2,ZHANG Xiao-Hua2
(1.College of Environmental Material Engineering, Yantai University, Yantai 264005,Shangdong, China;
2. College of Marine Life Sciences, Ocean University of China, Qingdao 266003, Shangdong, China.)
Abstracts: Diversity and actinobacterial diversity in the sediments of North Pole was investigated by selective isolation method. 109 actinomycetes were isolated using six different culture media(M1-M6). Bioinformatics analysis of the 16S rDNA sequences assigned the 34 representative isolates to three genera (Streptomyces, Pseudonocardia and Nocardiopsis), and Streptomyces was the dominant genus. The type of culture medium exhibited significantly the number and diversity of actinomycetes recovered. Out of 109 isolates, 39 isolates exhibited antimicrobial activity against human pathogens. The proportion of actinomycetes with antibacterial activity was highest from the culture medium M5.
Key words: North Pole; sea sediments; actinomycetes; diversity; antimicrobial activities
自从Ekelof 1908年首次报道从南极分离出微生物后,各国的微生物学家相继在极地进行过大量的研究工作,证明了微生物是极地生态系统的重要组成部分,特别是在极地的海水、海冰、海底沉积物中存在着各种类型的微生物[1]。由于极地所处的地理位置比较特殊,从而形成了一个寒冷、干燥、强辐射的环境条件,生存于其中的微生物必须具备相应独特的分子生物学机制和生理生化特征去适应这样的极端环境,特别是对于能够产生多种次级代谢产物的放线菌来说,极地应该是产生新型生物活性物质的放线菌菌株的重要生存繁衍之地[2,3]。对极地海洋沉积物中的放线菌进行分离培养、鉴定、抗菌活性等方面的研究,有利于进一步了解、开发和利用该地区放线菌资源。
为此,对来自北极的10份海洋沉积物样品进行放线菌的分离培养,通过16S rDNA序列测定,对分离出的菌株进行分子鉴定和系统发育分析,再对放线菌株进行抗菌活性筛选,希望能为今后极地海洋放线菌资源的研究和开发利用提供有价值的参考。
1 材料与方法
1.1 材料
1.
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