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- 2016-10-26 发布于湖北
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SNP检测技术 SNP 的概念 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),指由于单个核苷酸碱基的 改变而导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一 条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷 酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,即SNP。 它包括单碱基的转换, 颠换、 插入及缺失等形式 SNP在基因组内的形式: 一是遍布于基因组的大量单碱基变异; 二是分布在基因编码区(coding region) , 称其 为cSNP,属功能性突变。 SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的: (1)非转录序列要多于转录序列 (2)在转录区非同义突变的频率, 比其他方式突变的频率低得多。 SNP 的特点 在遗传学分析中, SNP 作为一类遗传标记得以广泛 应用, 主要源于这几个特点: (1)密度高 SNP在人类基因组的平均密度估计 为 1\1000 bp , 在整个基因组的分布达 3×106个, 遗传距离为 2~3cM , 密度比微卫星标记更高, 可以 在任何一个待研究基因的内部或附近提供一系列标 记。 (2)富有代表性 某些位于基因内部的SNP 有可 能直接影响蛋白质结构或表达水平, 因此, 它们可能代 表疾病遗传机理中的某些作用因素
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