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第十四章 遗传工程
利用转基因手段对生物进行人为改造的技术
什么是遗传工程?
体外DNA重组技术:利用工具酶将外源片段和载体连接,导入生物体并使其稳定复制和传代的技术
目的
研究工作
生物产品(生物反应器)
改良物种(提高品质)
基因治疗
工具酶
A. 剪切酶类
有目的有选择的把目的片段切开
B. 连接酶类
将目的片段和载体相连
C. 其他工具酶
修饰, 加工等作用
限制性内切酶II及其产生的3种不同末端
5突出的粘性末端
3突出的粘性末端
平末端
EcoR I
EcoR V
Pst I
P
P
P
P
P
P
同切酶和同粘酶
同切酶:
识别相同的位点, 但生成不同的末端.
同粘酶:
识别不同的位点, 但产生相同的粘性末端
Sma I
5′ ... C C C^G G G ... 3′
3′ ... G G G^C C C ... 5′
Xma I
5′ ... C ^ C CG G G ... 3′
3′ ... G G GC C ^ C ... 5′
同切酶
BamH I
5′ ... G^G A T C C ... 3′
3′ ... C C T A G^G ... 5′
Bgl II
5′ ... A^G A T C T ... 3′
3′ ... T C T A G^A ... 5′
同粘酶
Sau3A
5′ ... ^G A T C ... 3′
3′ ... C T A G^ ... 5′
连接酶及其对底物的要求:
T4 Ligase, Ecoli Ligase
底物:
自由5’末端和自由3’末端, 5’末端带磷酸基团
反应条件:Mg++,ATP存在
聚合酶(polymerase): DNA聚合酶I, klenow片段, Taq, Pfu, 末端转移酶
外切核酸酶(exonuclease): exo III, S1核酸酶, DNase I
脱磷酸酶(dephosphatase): 碱性磷酸酯酶CIP
磷酸化酶,激酶(kinase)
逆转录酶(reverse transcriptase)
RNase H, RNase A
甲基化酶(methylase)
其它工具酶
载体及其构成基本要素
能独立复制并稳定传代:复制起始点ori或自主复制序列ARS和着丝粒, 端粒
方便插入外源片段: 单酶切位点
选择标记: 药物抗性
报告基因: 插入筛选标记
易分离提取
高产率(多拷贝)
强启动子
多宿主
常用载体
质粒(plasmid),粘粒(cosmid),噬菌体,噬粒(phagemid), 病毒,PAC,YAC,BAC
特殊用途的载体
表达型载体, 分泌型载体,穿梭载体
宿主
繁殖快, 易于培养, 能够快速得到产物
对所携带基因的表达产物具有较高耐受性, 具有克隆最多种基因的可能
突变率低, 能够稳定忠实的保存被克隆基因
常用宿主
大肠杆菌: 繁殖快, 易培养, 易分离产物
噬菌体: 转化效率高, 易于保存
酵母: 繁殖最快的真核生物, 适于有蛋白质加工的基因表达
lacZ
如何提高克隆效率?
提高插入片段和载体的比例
尽可能采用粘端连接*
载体脱磷以降低载体自连
插入片段磷酸化
改进转化条件
问题:
有一外源片段用某种酶切,生成了5′ 突出粘性末端 5′ -GATC, 但是载体上的单酶切位点只能生成下面这几种粘性末端:
5′-CTAG
5′-TCGA
5′-TTAA
应当采用怎样的策略来提高连接效率?
不依赖于内切酶和连接酶的体外重组
位点专一性重组
(依赖于短片段同源序列的重组)
cosN, LoxP
LoxP
LoxP
cre
LoxP
LoxP
Transform
+report gene substrates
新鲜组织研磨或匀浆
RNA提取液
总RNA
过oligo(dU)柱
洗脱
mRNA
AAAAAAAA
TTTTTTTTT
AAAAAAAA
AAAAAAAA
rRNA
tRNA
mRNA
筛选DNA文库
用标记的核酸作为探针
用诱饵质粒筛选表达cDNA文库
探针标记
标记物:
同位素标记:32P
非放射性标记:荧光标记,生物素,dig(地高辛)等
变性
模板DNA
随机6核苷酸引物,
dNTP, 某种标记dNTP
DNA Pol I
5‘
随机引物
标记的DNA片段
REMOVE
REMOVE
Inserted DNA coding
Protein for detection
GAL4-AD
lacZ
bait DNA
Inserted DNA coding
Protein for detection
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