差异蛋白组学在中医药防治肾间质纤维化中的应用展望.pdfVIP

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差异蛋白组学在中医药防治肾间质纤维化中的应用展望.pdf

差异蛋白组学在中医药防治肾间质纤维化中 的应用展望 宋立群 1,马晓鹏1,宋业旭2,贠捷2,马艳春2倡 (1.黑龙江中医药大学附属第一医院肾病科,黑龙江 哈尔滨 150040; 2.黑龙江中医药大学,黑龙江 哈尔滨 150040) 摘 要:慢性肾衰竭是严重威胁全球人类健康的一类重大疾病,而肾间质纤维化(Renal Interstitial Fibro- sis,RIF)是慢性肾脏病进展至慢性肾衰竭终末阶段的病理表现和途径。 大量的临床及实验研究证实中 医中药在防治 RIF中具有一定的优势和特色,但其确切的作用机制及作用靶点不清,从而影响到其进一 步的推广应用,因此利用现代分子生物学技术,研究中医中药在肾间质纤维化防治中的作用机制及靶 点,将有利于中医中药的进一步发展。 关键词:差异蛋白组学;肾间质纤维化;中医药;展望 中图分类号:R256.6 文献标识码:A 文章编号:1002 -2392(2013)06 -0090 -03 收稿日期:2013 -11 -09 修回日期:2013 -11 -24 基金项目:国家自然科学基金资助(No 作者简介:宋立群(1957 -),男,主任医师,教授,博士研究生导师,从事 中医药防治慢性肾病的临床与实验研究。 倡通讯作者:马艳春(1972 -),女,副教授,硕士研究生导师,主要从事 、科研和教学工作。 蛋白质组学这一名词最早出现于 1994 年,由 Wilkins和 Williams 提出,是指一个细胞、组织或有机 体在特定的生理或病理时期,所表达的全部蛋白质整 体,包括细胞内所有蛋白质的存在形式以及活动方式。 其研究的主要内容包括:功能蛋白质组学、差异蛋白质 组学以及相互作用蛋白质组学。 其中差异蛋白质组学 是蛋白质组学研究的重要方法,它利用先进的蛋白质 分离技术,获得细胞及生物体在不同时刻或不同状态 下在蛋白质表达上的差异或变化,分析其状态是正常 或是异常的,从而能系统而完整的认识疾病发生过程 中或在药物干预下蛋白质的调控机制以及蛋白质之间 的相互作用。 1 差异蛋白质组学的分析和鉴定方法 1.1 所检测样品中蛋白质的提取 差异蛋白质组学的目的是分析生物体内整体蛋白 质,因此样品制备的目标是尽可能的提取样品中的蛋 白质,样品制备的过程是将相比的样品分别进行特殊 的理化处理,以去除样品内的非蛋白成分,而最大可能 的保留全部蛋白质,并进行提取,如果其中的部分蛋白 微溶于水或是疏水蛋白,就需要根据蛋白特性采取相 应的不同提取液进行逐步提取,以最大限度的提取生 物体内的全部蛋白质,提高蛋白质的分辨率[1] 。 1.2 样品蛋白质分离 样品中被提取出来的蛋白质理论上包含所提取样 品中所有的蛋白质,要对蛋白质进行鉴定就需要用一 定的技术进行分离。 电泳技术和层析技术是蛋白质分 离的主要技术。 1.2.1 染色技术 考马斯亮蓝染色( Coomas sieblu estaining),是快 速测定微量蛋白质的一种常用方法,该方法所需试剂 配制简单,操作过程简便快捷,灵敏度高[2] ,所需费用 低廉,结果可重复性好,并且该方法能更好的与胶内酶 解及质谱鉴定兼容,是目前最常用的染色方法。 1.2.2 高效液相色谱技术以及多维液相色谱技术 高效液相色谱技术(High performance liquid chro- matography,HPLC)经由普通液相层析和气相色谱改进 发展而来,其优点是具有高温、高效、高分辨率和高灵 敏度等特点,但由于其难以对样品中多组分蛋白进行 多维分析,仅适用一对单一蛋白质或简单样品中蛋白 质组进行分析,不适用于差异蛋白质组学研究。 多维 液相色谱技术(Multidimensional liquid chroma -togra- phy, MLC)是由高效液相色谱技术与串联质谱联用的 2D-LC-MS/MS,其优点是可快速、高通量鉴定负责 的蛋白质混合物,并且能对样品量较少的蛋白质进行 快速分析,是蛋白质组学研究最主要的技术。 1.2.3 双向凝胶电泳及差异凝胶电泳技术 每种蛋白质都有其相互独立的特性,即等电点和 ·09· 中 医 药 学 报 Acta Chinese Medicine and Pharmacology 2013 年第 41卷第 6期 Vol畅41,No畅6,2013 分子量,O'Farrell依据这种特性于 1975 年首次建立了 双向凝胶电泳技术( two -dimensional polyacrylamide gel electrophore -sis,2D -PAGE),实现了对复杂样品 中蛋白质的整体性分离,并最终获得样品整体蛋白质 的蛋白质组图谱, 但此技术也有一定的缺点:①该技术需要手工操 作,费时费力,并且需要操作者具有很高的

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